Basic Information

Symbol
MBP
RNA class
mRNA
Alias
Myelin Basic Protein Myelin Membrane Encephalitogenic Protein Myelin A1 Protein Golli-MBP
Location (GRCh38)
18:76978827-77133683
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001025101.2
Sequence length
2738.0 nt
GC content
0.5687

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-980.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1027.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 536.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001025081.2 NCBI
AGACCAUCCAAGAAGACAGUGCAGCCACCUCCGAGAGCCUGGAUGUGAU… 2235 nt 0.5539
NM_001025090.2 NCBI
AGACCAUCCAAGAAGACAGUGCAGCCACCUCCGAGAGCCUGGAUGUGAU… 2157 nt 0.5503
NM_001025092.2 NCBI
AGACCAUCCAAGAAGACAGUGCAGCCACCUCCGAGAGCCUGGAUGUGAU… 2124 nt 0.5499
NM_001025100.2 NCBI
AGUCACCGCCGCCGCGCGCCAGAGAGAAGCAGCCUCCGGCCCCGGCGGC… 4844 nt 0.4622
NM_001025101.2 NCBI
AGUCACCGCCGCCGCGCGCCAGAGAGAAGCAGCCUCCGGCCCCGGCGGC… 2738 nt 0.5687
NM_002385.3 NCBI
AGACCAUCCAAGAAGACAGUGCAGCCACCUCCGAGAGCCUGGAUGUGAU… 2202 nt 0.5536
Summary

The protein encoded by the classic MBP gene is a major constituent of the myelin sheath of oligodendrocytes and Schwann cells in the nervous system. However, MBP-related transcripts are also present in the bone marrow and the immune system. These mRNAs arise from the long MBP gene (otherwise called "Golli-MBP") that contains 3 additional exons located upstream of the classic MBP exons. Alternative splicing from the Golli and the MBP transcription start sites gives rise to 2 sets of MBP-related transcripts and gene products. The Golli mRNAs contain 3 exons unique to Golli-MBP, spliced in-frame to 1 or more MBP exons. They encode hybrid proteins that have N-terminal Golli aa sequence linked to MBP aa sequence. The second family of transcripts contain only MBP exons and produce the well characterized myelin basic proteins. This complex gene structure is conserved among species suggesting that the MBP transcription unit is an integral part of the Golli transcription unit and that this arrangement is important for the function and/or regulation of these genes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in Sprague Dawley rats demonstrated that adolescent morphine exposure in females caused transgenerational attenuation of morphine self-administration in offspring, with RNA sequencing and qPCR analysis showing the MBP was downregulated in the nucleus accumbens of both male and female F1 generation rats and exhibited sex-specific dysregulation in the F2 generation [Fair M. Vassoler et al. DOI:10.1016/j.neuropharm.2016.10.006]. A separate review on traumatic brain injury (TBI) in humans, rats, and mice identified the MBP as a protein biomarker of brain damage that can be measured in serum and cerebrospinal fluid to evaluate injury severity and correlate with morbidity and mortality [Annunziato Mangiola et al. DOI:10.1155/2015/736104].