Basic Information

Symbol
MC2R
RNA class
mRNA
Alias
Melanocortin 2 Receptor ACTHR Adrenocorticotropic Hormone Receptor Melanocortin 2 Receptor (Adrenocorticotropic Hormone) Adrenocorticotropin Receptor ACTH Receptor Melanocortin Receptor 2 Corticotropin Receptor MC2 Receptor ACTH-R MC2-R
Location (GRCh38)
18:13882043-13915707
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000529.2
Sequence length
3652.0 nt
GC content
0.4354

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1045.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1125.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1075.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000529.2 NCBI
AUUCCUUCUCAUUCAUUUUGCCCAGAAAGUUCCUGCUUCAGAGCUGAAG… 3652 nt 0.4354
NM_001291911.1 NCBI
AUCUGCCUGUGUCUUUCCAUUUCUCUAACUUCACAUUACCAGAAAUGCA… 3681 nt 0.4344
Summary

MC2R encodes one member of the five-member G-protein associated melanocortin receptor family. Melanocortins (melanocyte-stimulating hormones and adrenocorticotropic hormone) are peptides derived from pro-opiomelanocortin (POMC). MC2R is selectively activated by adrenocorticotropic hormone, whereas the other four melanocortin receptors recognize a variety of melanocortin ligands. Mutations in MC2R can result in familial glucocorticoid deficiency. Alternate transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

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