Basic Information

Symbol
APP
RNA class
mRNA
Alias
Amyloid Beta Precursor Protein Alpha-SAPP AD1 Alzheimer Disease Amyloid A4 Protein Homolog Amyloid Beta (A4) Precursor Protein Alzheimer Disease Amyloid Protein Cerebral Vascular Amyloid Peptide Amyloid-Beta Precursor Protein Amyloid Precursor Protein Peptidase Nexin-II Protease Nexin-II PN-II PreA4 ABPP APPI CVAP Amyloid-Beta (A4) Precursor Protein Beta-Amyloid Precursor Protein Testicular Tissue Protein Li 2 Beta-Amyloid Peptide(1-40) Beta-Amyloid Peptide(1-42) Amyloid Beta A4 Protein Amyloid-Beta A4 Protein Beta-Amyloid Peptide Alzheimer Disease CTFgamma ABETA AAA PN2 A4
Location (GRCh38)
21:25880535-26171128
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mixture deconvolution Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000484.4
Sequence length
3583.0 nt
GC content
0.4851

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1123.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1189.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1094.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000484.4 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3583 nt 0.4851
NM_001136016.3 NCBI
AAAUAGCACAGCCUUGCUGUGCGUGGUAGAAGUUGGGUUAGUGUUGACA… 3572 nt 0.4661
NM_001136129.3 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3190 nt 0.4799
NM_001136130.3 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3415 nt 0.4843
NM_001136131.3 NCBI
GUCGGAUGAUUCAAGCUCACGGGGACGAGCAGGAGCGCUCUCGACUUUU… 3295 nt 0.4692
NM_001204301.2 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3529 nt 0.4826
NM_001204302.2 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3472 nt 0.4827
NM_001204303.2 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3304 nt 0.4782
NM_001385253.1 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3415 nt 0.4808
NM_201413.3 NCBI
GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… 3526 nt 0.4853
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a cell surface receptor and transmembrane precursor protein that is cleaved by secretases to form a number of peptides. Some of these peptides are secreted and can bind to the acetyltransferase complex APBB1/TIP60 to promote transcriptional activation, while others form the protein basis of the amyloid plaques found in the brains of patients with Alzheimer disease. In addition, two of the peptides are antimicrobial peptides, having been shown to have bacteriocidal and antifungal activities. Mutations in this gene have been implicated in autosomal dominant Alzheimer disease and cerebroarterial amyloidosis (cerebral amyloid angiopathy). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that a Bayesian method (NOCIt) determines the a posteriori probability (APP) distribution for the number of contributors (NOC) in forensic DNA mixtures, incorporating models for peak height, stutter, and drop-out [Grgicak et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2021.102563]. A study in mice demonstrated that the APP is expressed in the brain following traumatic brain injury, colocalizing with astrocytes and macrophages/microglia in specific brain regions, and exhibits a sex-dependent expression pattern with higher levels in males at early time points post-injury [Soriano et al. DOI:10.1007/s10571-020-00808-3].