Basic Information

Symbol
MCL1
RNA class
mRNA
Alias
MCL1 Apoptosis Regulator, BCL2 Family Member BCL2L3 Mcl-1 Induced Myeloid Leukemia Cell Differentiation Protein Mcl-1 Myeloid Cell Leukemia Sequence 1 (BCL2-Related) MCL1, BCL2 Family Apoptosis Regulator Bcl-2-Related Protein EAT/Mcl1 Myeloid Cell Leukemia 1 Bcl-2-Like Protein 3 Bcl2-L-3 Mcl1/EAT BCL2 Family Apoptosis Regulator Myeloid Cell Leukemia ES MCL1-ES MCL1L MCL1S EAT TM
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_021960.5
Sequence length
3950.0 nt
GC content
0.4514

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1362.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1052.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUUCUCACUUCCGCUUCCUUCCAGUAAGGAGUCGGGGUCUUCCCCAGU… 3491 nt 0.4185
ACUUCUCACUUCCGCUUCCUUCCAGUAAGGAGUCGGGGUCUUCCCCAGU… 3950 nt 0.4514
ACUUCUCACUUCCGCUUCCUUCCAGUAAGGAGUCGGGGUCUUCCCCAGU… 3702 nt 0.4514
Summary

This gene encodes an anti-apoptotic protein, which is a member of the Bcl-2 family. Alternative splicing results in multiple transcript variants. The longest gene product (isoform 1) enhances cell survival by inhibiting apoptosis while the alternatively spliced shorter gene products (isoform 2 and isoform 3) promote apoptosis and are death-inducing. [provided by RefSeq, Oct 2010] CIViC Summary for MCL1 Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MCL1 is upregulated in endothelial cells of the corpus cavernosum from patients with erectile dysfunction, where it is associated with cell death in response to oxidative stress [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9]. A study in mice and human hematopoietic cells demonstrated that radiation exposure upregulated the MCL1 in a dose-dependent manner, and a luciferase reporter assay confirmed that miR-30 directly inhibits its expression by binding to its 3' UTR [Li et al. DOI:10.1007/s10495-016-1238-1].