Basic Information

Symbol
MCM5
RNA class
mRNA
Alias
Minichromosome Maintenance Complex Component 5 CDC46 DNA Replication Licensing Factor MCM5 CDC46 Homolog P1-CDC46 MCM5 Minichromosome Maintenance Deficient 5, Cell Division Cycle 46 (S. Cerevisiae) Minichromosome Maintenance Deficient (S. Cerevisiae) 5 (Cell Division Cycle 46) MCM5 Minichromosome Maintenance Deficient 5, Cell Division Cycle 46 Minichromosome Maintenance Deficient 5 (Cell Division Cycle 46) EC 3.6.4.12 MGORS8
Location (GRCh38)
22:35400123-35425431
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006739.4
Sequence length
3458.0 nt
GC content
0.5633

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1374.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1432.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 778.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006739.4 NCBI
CCGCGAAACUCGGCGGCUGAGCGUGGAGGUUCUUGUCUCCCCUGGUUUG… 3458 nt 0.5633
Summary

The protein encoded by this gene is structurally very similar to the CDC46 protein from S. cerevisiae, a protein involved in the initiation of DNA replication. The encoded protein is a member of the MCM family of chromatin-binding proteins and can interact with at least two other members of this family. The encoded protein is upregulated in the transition from the G0 to G1/S phase of the cell cycle and may actively participate in cell cycle regulation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MCM5 was upregulated in common in splenocytes at day 7 post-injury following burn or trauma-hemorrhage, where it was identified as a gene expression marker associated with DNA replication [Lederer et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00086.2007]. Separate research in zebrafish and mice investigating postmortem transcriptome dynamics identified the MCM5 as a cancer-associated gene whose transcript abundance increased after death [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].