Basic Information

Symbol
MCOLN2
RNA class
mRNA
Alias
Mucolipin TRP Cation Channel 2 TRPML2 TRP-ML2 Transient Receptor Potential Channel Mucolipin 2 Mucolipin 2 Mucolipin-2 FLJ36691
Location (GRCh38)
1:84925583-84997115
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153259.4
Sequence length
3044.0 nt
GC content
0.4317

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-883.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -946.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1008.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330647.2 NCBI
ACACAGAGCCGCCUUUCAGCCGCCCGAGAACUGCCCGCCGCACUCCACG… 3143 nt 0.4359
NM_153259.4 NCBI
ACACAGAGCCGCCUUUCAGCCGCCCGAGAACUGCCCGCCGCACUCCACG… 3044 nt 0.4317
Summary

Mucolipins constitute a family of cation channel proteins with homology to the transient receptor potential superfamily. In mammals, the mucolipin family includes 3 members, MCOLN1 (MIM 605248), MCOLN2, and MCOLN3 (MIM 607400), that exhibit a common 6-membrane-spanning topology. Homologs of mammalian mucolipins exist in Drosophila and C. elegans. Mutations in the human MCOLN1 gene cause mucolipodosis IV (MIM 262650) (Karacsonyi et al., 2007 [PubMed 17662026]).[supplied by OMIM, Sep 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.