Basic Information

Symbol
MCTP1
RNA class
mRNA
Alias
Multiple C2 And Transmembrane Domain Containing 1 Multiple C2 And Transmembrane Domain-Containing Protein 1 Multiple C2 Domains, Transmembrane 1 FLJ22344 Multiple C2-Domains With Two Transmembrane Regions 1
Location (GRCh38)
5:94703690-95285094
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024717.7
Sequence length
7325.0 nt
GC content
0.4223

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2244.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2375.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2290.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002796.5 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6306 nt 0.3603
NM_001297777.3 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6048 nt 0.3578
NM_001393535.1 NCBI
AGACGCGCCUUGUUGUGUGAGCCGCGUGCGCGCCCAAUUUGGAGGCAGC… 7247 nt 0.4213
NM_001393536.1 NCBI
AGACGCGCCUUGUUGUGUGAGCCGCGUGCGCGCCCAAUUUGGAGGCAGC… 7187 nt 0.4216
NM_001393537.1 NCBI
AGACGCGCCUUGUUGUGUGAGCCGCGUGCGCGCCCAAUUUGGAGGCAGC… 7148 nt 0.4219
NM_001393538.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 3942 nt 0.3874
NM_001393539.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6228 nt 0.3584
NM_001393540.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6186 nt 0.3600
NM_001393541.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6174 nt 0.3584
NM_001393542.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6168 nt 0.3581
Showing 1 to 10 of 19 entries
Summary

Enables calcium ion binding activity. Predicted to be involved in several processes, including modulation of chemical synaptic transmission; negative regulation of endocytosis; and negative regulation of response to oxidative stress. Located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MCTP1 is a gene marker enriched in a myeloid cell cluster (MonDC) within brown adipose tissue, as identified through single-nucleus mRNA-sequencing [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252].