Basic Information

Symbol
MCTP1
RNA class
mRNA
Alias
Multiple C2 And Transmembrane Domain Containing 1 Multiple C2 And Transmembrane Domain-Containing Protein 1 Multiple C2 Domains, Transmembrane 1 FLJ22344 Multiple C2-Domains With Two Transmembrane Regions 1
Location (GRCh38)
5:94703690-95285094
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024717.7
Sequence length
7325.0 nt
GC content
0.4223

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2244.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2375.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2290.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001393543.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 3804 nt 0.3849
NM_001393544.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6129 nt 0.3581
NM_001393545.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6123 nt 0.3582
NM_001393546.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6087 nt 0.3598
NM_001393547.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 6069 nt 0.3580
NM_001393548.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 5972 nt 0.3580
NM_001393549.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 2175 nt 0.4308
NM_001393550.1 NCBI
AUUCCAAGUCGCUGCUGUGCAGAGCAGCAAGUGCUCCGUGCAGGGCUGU… 1749 nt 0.4334
NM_024717.7 NCBI
AGACGCGCCUUGUUGUGUGAGCCGCGUGCGCGCCCAAUUUGGAGGCAGC… 7325 nt 0.4223
Showing 11 to 19 of 19 entries
Summary

Enables calcium ion binding activity. Predicted to be involved in several processes, including modulation of chemical synaptic transmission; negative regulation of endocytosis; and negative regulation of response to oxidative stress. Located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MCTP1 is a gene marker enriched in a myeloid cell cluster (MonDC) within brown adipose tissue, as identified through single-nucleus mRNA-sequencing [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252].