Basic Information

Symbol
MDGA2
RNA class
mRNA
Alias
MAM Domain Containing Glycosylphosphatidylinositol Anchor 2 MAMDC1 MAM Domain-Containing Glycosylphosphatidylinositol Anchor Protein 2 MAM Domain Containing 1 MAM Domain-Containing Protein 1 C14_5286
Location (GRCh38)
14:46840092-47675605
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001113498.3
Sequence length
5726.0 nt
GC content
0.4453

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1714.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1814.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1622.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001113498.3 NCBI
AUUCUCCCUCUCUUGCAAGUGGCGGUGCCUGGACUCUGCUUUCGGCUCC… 5726 nt 0.4453
NM_182830.4 NCBI
UAAUCGUUCCUGAAAAAAACAAACAAACAAAAAAAAUCACCAUUCCUUU… 5250 nt 0.3859
Summary

Predicted to be involved in regulation of synapse organization and spinal cord motor neuron differentiation. Predicted to act upstream of or within several processes, including motor behavior; negative regulation of neuron apoptotic process; and neuron migration. Predicted to be located in extracellular region and plasma membrane. Predicted to be active in GABA-ergic synapse; glutamatergic synapse; and postsynaptic density membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MDGA2 transcript, a neural development protein, increased in relative abundance within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].