Basic Information

Symbol
MDM2
RNA class
mRNA
Alias
MDM2 Proto-Oncogene HDM2 MDM2 Proto-Oncogene, E3 Ubiquitin Protein Ligase E3 Ubiquitin-Protein Ligase Mdm2 Oncoprotein Mdm2 MGC5370 Mdm2, Transformed 3T3 Cell Double Minute 2, P53 Binding Protein (Mouse) Mdm2, Transformed 3T3 Cell Double Minute 2, P53 Binding Protein Mouse Double Minute 2, Human Homolog Of; P53-Binding Protein Double Minute 2, Human Homolog Of; P53-Binding Protein Mdm2, P53 E3 Ubiquitin Protein Ligase Homolog MDM2 Oncogene, E3 Ubiquitin Protein Ligase Mdm2 P53 Binding Protein Homolog (Mouse) RING-Type E3 Ubiquitin Transferase Mdm2 P53-Binding Protein Mdm2 Double Minute 2 Protein EC 2.3.2.27 EC 6.3.2 ACTFS HDMX LSKB Hdm2
Location (GRCh38)
12:68808175-68845544
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002392.6
Sequence length
7490.0 nt
GC content
0.3947

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2137.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2285.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2012.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.((((.((((.(((((.......)))))....((((((.....)))))))))).))))......((.((..(....)..))))((((((((....)).))))))((.(((((((((((((((....)))).))))(((((((((.....((((....((((((..((((((....(((((((((((((.((.........)).))).)).))))))))..))))))..))))))..((((..(((...(((((.((((....)))))))))..)))...))))......))))..(((.(((.(((((((..(((.........)))))))))).))))))))))))))).....((((..(((((((..(((((((((((((..(.(..((((...))))..))..))).)))))))))).....))))))).))))...(((((((..(((...........)))..))))))).))))))).))..............((((((.((((((((.(.........).))))))))))))))(((((((((((....)))).))))))))))))))....(((.(((((......))))))))......(((((.(.(((...))).).)))))..((.((((((((.((..((((((((.((((((((((((((........)))))))).))).)))(((((((.(.(((((..(((..(((......)))..((((((..(((((((...............)))))))((((((((....(((((..(((((((((....((.((...(((((((.(((((....))))).)))((((..............)))).....)))).)).)).....)))))))))))))).(((...)))..(((((......((((((.(((.(((((....(((((.(((((.((.((((((.((((...((((((.(.((((((((((((((((.....(((....)))....))))))...)))))))))).).))).)))..))))..)))))).(((((.(((((.....))))))))))..((((......))))(((((((((((((.(((((((....(((((((((((.(((((((((((((((.....)))..((((((((((..(((((..(((((((((............((((((.(((....)))..))))))....(((((........)))))....(((((((((..(((((......))))))))(((.(((....)))..)))(((((........)))))......)))))).......((((....(((...)))....))))..(((.((((...((((((....(((((((.((((((.......))))))..(((((((....)))))))(.((((((((...((((......))))....((((((((..((....))..)))))).)).))))))))).....(((((....((((.......((((((((..(((((((..............(((......)))....((((..(((..........)))..))))..(((...((((((.((((((((..........))))))(((((.......))))).....)).))))))....)))))))))).))).)))))......))))..))))).........)))))))))))))...)))).)))..........))))))))))))))...))))...)))))).(((((.....(((.((((((.(((((((........)))))))....(((((((((.......(((.((((.(((((..........))))).))))...))).......)))))))))))))))))).....)))))(((((.....))))).(((((((....)))))))....))))))))...)))).))))))................((((......))))........)))))...)))).))).))).)))))))))).(((((((...(((....((((....)))).......)))....))))))).....))))))))))))((((((((.(((((((((((((.........)).))))))..)))))))))...))))))))).)))))))))(((..(((..........))).)))...(((....)))....)))))((((((((...(((.((((...)))).)))((.(((...))).)))))))))))))))))).....)))))))))..)))))).)))))))..((((((((...((((.(..((((.(((....))).(((....))).((((((.((((.((....((((.......))))....)).))))...))))))..(((((((((((.(((((((.(((((((((((((((..((((..((.((...((..((((((((.(((((((((((....(((......)))...(((((..(((((..(((((......))))).)))))..)))))((((((((((((.((((((......))))))..(((((...........)))))...((((((......)).))))((((((((.(((...........((((((....))))))))).)))).))))(((((......))))).....((((.((((.((..(((((((..(((((..(((((((((...)))))))))..)))))...................))).))))..))...))))))))..((((((......))).))).)))))))))))))))))).))))).)))...))))).))))))..))))(((.....(((((((((((..((((((((((((((..((((((..(((..((((..(((((((.....(((((.(((((.((((.((((....((((((...))))))..)))).))))(((((.(((.((((.......((((((..........))))))((((.((((.((((((.....)))))).)))).))))...............))))))))))))...............))))))))))....)))))))..))))..)))...))))))....(((((.(((((((..((((((.((((((((..........((.((((((...)))))).))(((((((..(((.....)))))))))))))))))).))(((((.((((((((.....)).))))))))))).....(((....))).........((((((........(((((((((((...(((((((((.......)))).)))))...)))).))))).))...........))))))..(((((((((((((((((..((((((....(((((.((((((((.............((((((.......((((((....(((((((....)))))))...((((........)))).....(((((.....)))))........((((((((..((((.((((.((((((....((((((...((((.(((((((((((...(((...))).)))))..))))))(((((.(((.(((....(((((((((((((((((((........((((.........))))........)))))))))...))))))))))))).))).)))))..((((...(((...((((.(((((((.((((((.....(((((....(((..((((((.((((((((((...((((..(((((((((((((((((...(((((.((((((....)))))))))))...)))).))..)))))..))))))...)))).......(((.((((((((.((((.(((((((..(((....))).....(((((...((((((...((((......))))...))))))..)).))).......((((((..(((((((((((.(((.(((((((..((((((((((((((...(((.(((((..((.((((.(((.(((((.......((((((........((((((((((......((((((((((((((((((.....((((...............((((....)))).......(((((......)))))..(((.((...)).))).))))....(((((((....((.(((((............))))).)).....)))))))..........(((((....(((.((((((..(((((((.........................((((.............)))).(((((...))))).(((((...)))))................(((((((((((((...(((((..((((((((....)))))))).))))).((((((((.....((((((..((((((......)))))).)))))).....((((((....(((........)))..)))))).))))))))..(((((((...))))))).....(((.((((((.(..((((.((((..(((...)))..))))))))))))))).))).......(((((......)))))...........((((((......))))))(((((((...(((((((......((((.(((((.....((((((......))))))..))))).))))........)))))))....))))))).........))))))))))))).))))))).)))))))))..)))))))))))).))))))))))).((.(((.((.((.(((....(((((......))))).))).)).)).))).))....(((((.((((((((((......))).((((((.((.(......).))))))))..((((........))))((((.......))))))))))).)))))(((((((((((((.(((.(((((((((((.(((..........))).)))))))))))..))).))).........))))).....((((((........).)))))..(((.(.......)))).((((......)))).........(((((((((..(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((......((.(((((((((...(((.((((((.....))))))))).(((((((((....((((........))))..)))))))))(((((((......)))))))..((((........)))).....))))))))).))......))).)))..)))).....((((((...(((((..(((((((((....)))))))))((((((...(((((.............(((((((.((..(((((.((..((((((.....))))))....)).)))))..)).)))))))....)))))..)))))).........)))))...)))))).((((((..((((...))))....)))))).....))))))))))))))))))......)))))))))))))))))))))))))))).))).......((((.(((((((((.((..(((.((((((.......)))))).)))..))))..............))))))).))))(((((((((((.((((((((.......(((((((((...))))))))).......))))))....)).)))))....))))))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))).((((((...))))))....)))))..))))))))))(((....)))........))))))......))))).)))))))..))...))))).)))...))))))))))))))....(((.((((((..((((........))))..))).))).))).))))))).)))))))........(((((((....(((((((((((((.........)))))).)))))))....)))))))..)))))))...)))))).((((((((((((...))))))))))))....((((....))))...(((((((((.....(((...(((...)))...)))....))))))))).......))))))).)))).)))))))))))(((((....))).))..))))))))...)).))..))))...)))))))).....))))))......)))))))))))...)))....))))((((((((((...(((...(((((...((....((((.(((...(((((((((((((((.((.((((((((.....((((((((..(((((.((((((((..(((((((..((((...(((((((((((((((((..((((..(((((.........)))))...))))..))))))))...((((....))))..................(((((((......(((.(((....))).))))))))))..))))))))).....))))...)))))))...))))))))(((((((...)))))))......................((((((((((((...)))))))..)))))))))).....))))))))....))))))))..))..)))))(((....)))............(((((((((((((..(....)..))))))).)))))).))))))).))).))))).)).((((((((.......))))))))))...))))))))...))))))))))((.(((......)))))....((((((....(((.((((....)))).)))....))))))))))..))))))....)))))).)))).)))).)))))))).......)))))).)))))))))))))).)).)))....))))))))))....(((...(((((...)))))..)))...))))))))))))).))))..))))))).)))))...........((((((.....))))))....(((((......)))))..))))))))))....((.((((...)))).))(((((((..(((......((((.....((((.......)))).....)))).......)))..))))))).)))).)))))))))))...)))....)))))))....)))))))).)))))))))))))))))).......))))..).))))..))))))))...(((((...................))))).....((((((((((.(((.......))).)))).)))))).)))).))))...))...)))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((.((({.{{{{.{|||(..,,,{,|||||,,,.((((((.....)))))))}}},||}}...,,,||,||..,..,,),,))})((((((((....)).)))))),(.(((((((((((((((....))))},)))(((((((((,,...((((....((((((..((((((...,(((((((((((((.({.........)),))).))})}))))))..))))))..))))))..((({..(((...{((((.((((....)))))))))..)))...))))......))))..||{,(((.(((((((..(((.........)))))))))).))),},))))))))){{...((((..(((((((..(((((((((((((..(.{..((((...))))..})..))).)))))))))).....))))))).)))).}}{((((((..(((...........))),.))))))).))))))).}||,........,,..((((({{((((((((.{.........).))))))))))))))(((((((((((....))))))}))))))))))))....(((.(((((......))))))))......(((((.(.(((...))).).)))))..{(.((((((((.((..((((((({.{(((((((((((((........)))))))).)))}||}(((((((.(.(((((..(((..((({{,,{{|{|{.,((((,.,(((((((...............))))))){({{{{{|....(((((..(((((((((..,.{(,((...(((((((.(((((....))))).)))((((..............)))).....)))).}}.)),}...))))))))))))))...||}|||}}|,,||||,.,,,|(((((.(((.(((((,...(((((.(((((,{,.{,{,{{,({{{,,{(((((,.,.,,,,,|||||||(((({{,,.{{,.,|||}|,{{{{||,,|{{{}||||{{{{{{{{(((({{{,.,,,,..,},,)}}}}}|}}|||||}}},|}|))|}))),,||}|,..,|||,||,|,,{{{{|.,,,,.,||||{,...,{{{,.((((((.((((((((((((,{{.,..,|||{,((((((((((..{{((.,.(((((((((...,....,,..((((((.(((....)))..)))))).}|.{((((........}))}}....((((({(((..(((((......))))))))(((.(((....)))..))){((((........)))))......}})))).......((((....(({...}))....))))..(((.((((...((((((,...{((((((.((((((.......))))))..(((((((....)))))))(.((((((((...(({(......)))}....((((((((..((....))..)))))).)).))))))))},....(((((....((((.,,.{{.((((((((..(((((((..............(((......)))..,.((((..{{(..........)))..))))..(((...((((((.((((((((..........))))))(((((.......))))).....)).))))))....)))))))))).)))},)))).}}.,}))))..))))).........)))))))))))))...)))).))).,........))))))))),)}))...})}}.,})))))).,|||,..{{{(((.{{{(({.(((((((........)))))))..,,,{{{{{{||},,....|||.{{{{.{((((.,.,,,..,,|}|}|.}}}}...}}}.......}}}}))))))))))))}),},}.,}}}}(((({...,,))))).(((((((....)))))))....))))))))...)))).)))))).}}}}},,,,.....,,,,,......,,,,...,{{{.|||||{{.,|||{{||{,|,{{{{,|,|||,....,,,,,{,{{,.,..||||..,,)}},}}},,,,)))})}})))))))),)))),}))))))))){(((((((.(((((((((((((.........)).)))))),.}))))))))...))))))))).))))))))}(((..(((..........))).)))...(((....}})..{{{{..{((((((({...,{(.((((...}))).))|((.(((...))).))))))))))),))))}}.....,})))})))..)))))).))))))),.((((((((...((((,(,.({((,(((....||}.,,|,.,,,})}||{{{{.|{{{.||,,.,((((.,,,,,.}},}....}),))}),,,}}}}}|,,(({((((((((((((({(({((((((({((((((((((.((({{((..(((((,({{,.,((({((((((,,({{{({(,((((.((((((((,(((((,.(((((..(((((......))))).)))))..)))}}|||||||},}.,,((,,{{,,||,,,,|||||||||.,....,.{,,,.,,}||||||||{{({,....}|,|{||((({((((,(({,.,,,,,,,,{((((((....)))))))}|.|}}}.))||,{||||||,|{.||||||||||}}||||{{|..,,|.|||||}}(((((..(((((((({...}))))))))..))))}....................,|,))}}|||....||||,|||(((((.((..{{{{|{{{|||{||,,....,))))))))))}})),,)),,,,}}}||,,.|{{,,..{{{{{|,,,.,(((((((({{{..{{||||,{{(({(|{{{(({{{.,,{{,.,((({{{,,,,,{,,,..,||||,,{{(((((((...{{{...{{{{{{.{((((({.,{(((,..,,.....}}}}((((.....)))}.|||||}|{{{{....,,))))((((.((((.((((((.....)))))).)))).))))..,,,,,..{{{,(({|{{{,,{{{{{{{{{({,.......{((({|(((({{{,....,|||.(((({,,||{...|(((||{{{,,,{{,,({{{,,,.,|||{((.((((((((..........((.((((((...)))))).))(((((((..({,.....,),))))))))))))))).)){((((.((((((((.....)).))))))))))},{{{{({(,...||}........,|{||||,..,{{{|,,{{||{,.,||,}||{{|||||,,..,,,}})).))))).}|||}},||||}|||,.,,|||,,..)))),,,,|||||,|,|||,,((((,...|}}},...((({..{(((((({...}))),,.},.{||||{.,,,},,||,.......(((((((....)))))))...((((.{....}.)))).....{((((.....))))},{{({{,.(((({{{({,...{{{,{(|{(((((....{(({,{|||||||||}}|{{|||{{..|||||,|}}..{|||||||,{{{|{{((({(({.{{,....{{{|{{{{{{{{(((({,(,{,....,|||,.|,....,.}}}),,,,.,},,})))}}}},.{|||||||,,,)))}))),,||||||{{{{{{||,.,,,{{||.{((({((..((({((.((((.(,(((((....)))))}.}}}}.,,||,|||||{||,.(((((((((((((((((...(((((.((((((....)))))))))))...)))).))..))))}.})))))).,.}}||,,,..{|{{{,(((((((|,({{{.((({(((..{({,,..,,,.....{(({(...{(((((...((((......))))...)))))}..})}}}}....||,{((({{..{(({{{{|||..{{,.{|||{{{..(((((((((((((({,{(((.(((((..(,.((((.(((.(((((...,,(.((((((..,{,,..((((((((((.,{..,((((((((((((((((((,....((((..,,.....,.....((({....}))}.......(((((......)))))..{{{.{{...,,.))}.)))}....(((((((....((.(((((.,.........,))))).)).....)))))))....,{{{{{.,(((.,{.{{(,({{(((.{((((((,....,,,},}}......,,,,..,,{{{{|.||,,,,.....},,..(((((...))))).{((({...))))}......,,,,,.,,..{((((((((((({...(((((..((((((((....}))))))).))))}.((((({{{...,||.{{{{{|((((((......)))))}))))))}}.,,.{(((((....{{(.,....,,)}),.)))))}.)))))))}..(((((((...)))))))..,..,{{.((((((.{..((((.((((..(({...}))..))))))))})))))).}||.,.,,..(((({......))))).........,.((((((......))))))((((((({{.(((((((.{{,..((({.{(({,...{(((((((......))))))})))))}.}))).....,},))))))).}}.))))))).........))))))))))))).)))))),.)))))}))),})))))))))))).))))))))))},}.,|{{.{{{(({({{.,..{((((......))))),))).},.}}.})}.|,,,..{{{{,.(((((({{{{......,,,,(({{{,,||,|,,,,,,|,||}}}}}}.,{{{{..,,.,},}}))||||,|||,,.}||||}|||}|,|||}}(((|{{((,((((.(((.(((((((((((.(((..........))).)))))))))))..))).)))}....}}}}}}},,.,,},|{||||||,..,,,)}},,,,..,{{,{.......)))),|{||,.....}}}}..,,,....(((((((((..(((((((((((((((({{(((((((((((((((((((((((({{(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((......{{.(((((((({...(((.((((((.....))))))))).{((((((((...,((({...,}}},.,....))))))))|(((((((......))))))),.,,{(..,,,,..,,))},...))))))))).}}......))),}))..)))).....((((((.{.(((((..(((((((((....)))))))))((((((...(((((.............(((((((,.((((((((.((..((((((.....))))))....)).))))))).).)))))))..,.)))))..)))))).........))))).}.)))))).((((((..((((...))))....)))))).....)))))))))))))))))),.....}))))))))))))))))))))))))))).)))}}}|.,.((((.((((((((,.....(((,((((((.......)))))).}},,,}})}{((,....,.,,,,))))))).)))).|,|{,.,,,({((((((((.......||||||||},..,||||||||....,.|)))|||,{..,),})},},,..))}}}}.,,))}))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))).{{{(((,,.})))}}..,}}}}.,..)))))))))){({....})}.,}}}...))))))...,,,))))).)))))))..),...)))))}))).},))))))))))))))....{{{.{{{{{{,,||||,,,,,,.,)))),,))),)}}.}}}.}))}}}},}}}}}}}|,,,.,,.{((((((....(((((({((((((.........)))))).}))))))....)))))))..))}))),...}})))}.{(((((((((({...)))))))))))}....{|||,..,)))),,.(((((((((.....(((...(((...)))...)))....))))))))).......))))))},|}}}.}))))))))))|||{{....))),)}..|}})})))}..}},,}}||.,}}}}},}))}}},}}}.,}}}})}}....))))))))}|,(((((((((...{{...},})))))))),||{{,.,,,,)))}....,))))))}})))})))}.))))))}))))}}|}}|}||}}...{{{{{{{,.}|||||,||({{{{{,,(({((((,.{(((.,.{((((((((((((((((..((((.,(((((.,......}))))).}.))))..))))))))...((((....))))..................(((((((......(((.(((....))).))))))))))..))))))))),....)))).,,))}}}}|,,,||,,,,.((((((((...}))))))}.,.,,,}})))}},,.......{({{(((((((...)))))))..))))}))))).},}.}))))))),..,,)))}}||||}}|,|}}}}|||,...|||.{,|,.,.,|,|(((((((((((((..(....)..)))))))},))))),)}})},},}}},}}}..{{{.((((((((.......))))))))..}}}.,|{{,.{{..((((((((,((((....{{{..{{....},})}.....)))))))}}))))..,}},|}}|{{{{|.,|||,||(({{||||..||,)))}||{||,,..,))}}},,,,,}...,}}})}}}}||))}|}},.))))))}},.})),,.||||||||,,,...}}}|}}}}|{{,.,,,,,,{((((.(((.{({|||(((((|.{(||(((({..|{((...(((((((...........)))))))...))}|,{{,,{......}}},.,})},)))))))}...})))))))})).)))))))}..,,{{{{{.{{{{{{,{,,,,,.,,,..).}}}})).)}}}}.||||.||}}}.,,,}})}}))}}.)))),))))))}})))}.,)))}}}.,)),,)),.,,)))))))).}))))))))))))))))}..,,,,.)}))..).))))..))))))))..,{{{((...,,{{,,,..,,.}..,)))),..,,,{(((((((((.(((.......})}.))))},))))).}))),})))...))...)))))))).)}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145337.3 NCBI
AGUGGCGAUUGGAGGGUAGACCUGUGGGCACGGACGCACGCCACUUUUU… 12239 nt 0.4132
NM_001145339.2 NCBI
GUAGGGGGCGCGCACCGAGGCACCGCGGCGAGCUUGGCUGCUUCUGGGG… 7330 nt 0.3937
NM_001145340.3 NCBI
AGUGGCGAUUGGAGGGUAGACCUGUGGGCACGGACGCACGCCACUUUUU… 11792 nt 0.4135
NM_001278462.2 NCBI
AGUGGCGAUUGGAGGGUAGACCUGUGGGCACGGACGCACGCCACUUUUU… 11870 nt 0.4133
NM_001367990.1 NCBI
UGUGUUCAGUGGCGAUUGGAGGGUAGACCUGUGGGCACGGACGCACGCC… 7131 nt 0.3847
NM_002392.6 NCBI
GGGCGCGCACCGAGGCACCGCGGCGAGCUUGGCUGCUUCUGGGGCCUGU… 7490 nt 0.3947
Summary

This gene encodes a nuclear-localized E3 ubiquitin ligase. The encoded protein can promote tumor formation by targeting tumor suppressor proteins, such as p53, for proteasomal degradation. This gene is itself transcriptionally-regulated by p53. Overexpression or amplification of this locus is detected in a variety of different cancers. There is a pseudogene for this gene on chromosome 2. Alternative splicing results in a multitude of transcript variants, many of which may be expressed only in tumor cells. [provided by RefSeq, Jun 2013] CIViC Summary for MDM2 Gene

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) induced the MDM2 (HDM2), which was upregulated 1.82-fold 3 hours post-irradiation [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].