Basic Information

Symbol
MEF2A
RNA class
mRNA
Alias
Myocyte Enhancer Factor 2A RSRFC4 RSRFC9 Serum Response Factor-Like Protein 1 Myocyte-Specific Enhancer Factor 2A MADS Box Transcription Enhancer Factor 2, Polypeptide A (Myocyte Enhancer Factor 2A) ADCAD1 Mef2 MEF2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001319206.4
Sequence length
5580.0 nt
GC content
0.4057

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1499.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1603.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1574.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((.....)))(((...(((((((((.......)))).)))))...)))(.(((((((((((((.((.((.((....)).)).)).)).)))))))).))).)((((((((((..(((((((((((.........))))))..(((((((((((.........((((((((.....).)).))))).........)))))))))))(((((((((.(((((...)).)))..)))))))))..((((((.((((.((.((((((...((((.(((((..((((((((((((((....(((..(((..(((((((...((((((..(((((((.....(((((((...................)))........((((((..(((....)))..))))))..........((((((((((.........(((((((((...(((((((.((((((((((((((.............)))).))))......(((((((((((..((((((.....(((...((((...))))...)))))))))..)))............(((((.(((((((((....(((((((((..(((.((((.......))))(((.....)))..((((((..(((.((((..(((.....))))))))))....))))))((((.(((((.(((....((...(((((((((.....)))))))))....))......))))))))...))))....)))..))))))))).......((((((...(((((....(((...................(((((((...(((.((((((((.....((..(((.((((.((((.(((((....((...(((.((((..(((((...((((((.......))))))....((((((((.((((((............((((...(((.((((((((((((((((((...........)))))..((((((((((((.....))))))((((((.(..((((......))))..)))))))......(((((((((...((((((........((((((......))))))(((.((..((.((.((....)).)).))..)).)))((((((.(((((((...((((.(((((.....(((((...(((((.....))))).))))).(((((......)))))..))))).)))).(((((.......((((((.....)))))).......)))))............((((((.(((((.((((....(((((((((....)))))..))))))).).)))....))))))))))).....)))).)))))).(((.((((.(((((((((((((((......))))........((((((......)).))))))))))..))))))))))))..))))))(((.(((..(((.(((((((((.........))).)))))).))).))).))))))))))))..))))))................))))))))((((((((..(((((((........)))))))..........))))))))...((.((.((.((.((.((....)).)).)).)).)).))..))))))))...))))(((((......((.((((((...((....))...)))))))).....)))))....)))))).))))))))..(((((......)).))).....(((((((....(((......))))))))))....(((.((((.......)))).))))))))...)))).))).)))))))..))))..))))..)))..))))))).)))))).)))))))..(((((...((((((((.((((((((((((((((((((.(((...((((......))))....))).)).).)))).((((((((((((.(((((((((((((((..........))))))))))))))).)))))))))))).(((.(((.(.(((((.....))))).).))).)))...((((((((.....)))))))))))))).(((.((((....)))).)))..(((((((....((((((((.(((((((.....))..)))))((.((((((((((((((.....))))))))...)))))).))((((((..........(((...((((.((.....)).)))).)))....((((((.(((((..(((((..((((...)))))))))..))))).))..((((((((...)))))))))))).....((((......(((((......((.((((...))))))......)))))...))))..))))))))))).)))...)))))))..((((((.(((((.((((.......(((((((..........((((...((((.....((((((....))))))))))...))))..........((((((.....))))))....(((((................)))))...........(((((......))).))..((((..((((.........))))..)))).....((((.(((((((((((((((((......................))))))))).........(((((((.....)))))))(((........))).......((((.(((((((((.........(((.......)))((((((...(((.((..((((....))))..)).)))...))).)))..........(((((.....)))))..(((((((((((.(((((((((((((....((((...............((.((((......)))).))...............).))).....))))).)))))))))))))))))))........))))))))))))).....(((((((.......))))))).......(((((((...(((((....)))))...)))))))....((((....)))).....(((((((....((((((((((......((((((....(((((((((..........)))))))))....)))))).))))))).......((((((((.......(((((((((((.(((((((((((((((.((.((((((.((...(((((((((.((((((((((((((((((...((((((.(((((((.....((((((((.(((........)))))))))))...........))))))).))))))((((.((((((((((((((.(((....))).))))))))(((((............)))))))))))))))....((.((.((......(((.......((((((....))))))......)))....)).)).)).)))))))))))).............(((((((........)))))))(((..((((((......))))))..)))((((....)))))))))).)))..))))))...)))))))).(((((((((..(((((...))))).)).))..))))))).)))))))))).)))))...)))).)))))))((((.......)))).((((....(((((.((.(((....((((........))))....))))).)))))....)))).........(((((((........)))))))...))))))))...)))..((((((((..........(((((((.....(((((((((((((((((...((((..............)))))))))))))).(((.(((.(((((......))))).))).)))...)))))))....)))))))))))))))...............)))))))............)))))))).))))........))))))).....)))).)))))...))))))...))))))).)))))))))))))(((((.....)))))))).....)))))...))))))))))))))).)))))))))))))..((((((..((((((.((((((.....((((((((.((((...))))))))).)))..((....))....))).))).))))))(((((....)))))...............))))))......)))))))))))))..))))).))))......))))))))))..........)))).......))))....)))..))))))...)))))))..)))..)))...)))))))))......))))).))))).))))....)))))))).))))..)))))).(.((((..((((((((((((..(((((((..(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((.......((((((......))))))...(((((((.((.(((((.....(((((....))))).......((((((....((((........))))..))))))........(((..(((((....((((.(((((((((((...)))))......................((((((.....)))))).)))))).))))..))))).))).......(((((((((.......(((((........))))).......)))))))))))))).)).)))))))(((((.((((.(((((((((....(((((((((((..............))))..).)))))).....)))))))))))......................((((......)))).........((((.......)))).......(((((...(((.((((((......)))))).)))..)))))......((..((((((......))))))..))..((((.((....)))))))).)))))..........))))))).)))).........(((.((......)).)))......(((((((((((((...)))))))..........))))))((((((.....)))))).......(((((((.............)))))))........)))))))))))))).))))))))).....((((......(((.......))).....)))).........))))))).........((((....))))))))))))))))..)))).)....((((((((......))).)))))(((((.(((((((((.((.((((((..((((....))))..)))).)).)).))))))).))..)).))).(((((((......).))))))..(((((((.........))))))).((((((((.(((.....)))))))))))...(((((((.(((.((((....))))...))).)))))))......(((....((((((....((((((((((...(((((...............)))))...))))))))))))))))...)))....))))).))))..))))))))))).....(((((........)))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((({((,....}}|(((.{.(((((((((.......)))).)))))|..)}}{.{((((((((((((.((.((.((....)).)).)).))))))))))).))}||({{{{{{{((..{{{{{((((((.........)))))},{(((((((((((.........(((((((,.....}.)).))))).........)))))))))))||(((((((.(((((...)).)))..)))))))}}..((((((.{(((.((,((((((.,,((((.(((((,,,,((((((((({((....{((..(((..(((((((...((((((..{((((((.....(((((((...{,.........,,...)))......,.((((((..(((....)))..)))))},.........((((((((((..,......(((((((((...(((((((.((((((((((((((.............)))),})))......(((((((({((..((((((.....(((...((((...))))...))))))))}..)}}............(((((.(((((((((...((((((..((((((,.{(({...,}}}...((..(((((((..,((.(((((((((((((((......(((((((...{{....}}))))))).......)))))}.......(((((((((.....)))))))))...{.(((..{{((((.(((......(((,,(........)))))...}})..})}).))...))).,..((({{{((((({.......{{{(,,,,..,,||||,||,,(((,.,,|||.{{,.(((((...(((.(((((((((....{(((({{,((((((((..,(({{,({{...,..,||,(((({,{((.....,})})))))}},,..}}}.)))...)).)))))))}.,..))))}{{,,.,,(((,,({{|.{{...{||,||||..,,}})))}}))))})..))))))))).)))....))))).||||||,...,.}})))),,.,|||||{.....{{,((((((......))))))..,}}|}|||,,,.{{.,,,{{{(({(|{......,((((((.(((((((...{{,(.{{{{|..,.|(((((...(((((.....))))).))))),(((((......))))).,||||}.}|||.((,,.....,,{((((,{.,{,.|||}}}.,}}.}}).,.))))),.......((((((.((,(({((,,,,..(((((((((....)))))..)))),)).,,)))}}..))))))))))),,...,})).)))))).(((.((((.(((((((((((((((......))))........(((({{......}}.)))))))))),.})))))))))))..})))))}})))))))))))(((((((((.........)))}}))))).......)))))))))}}......)))))))..))........,.|}))}}....}))))}..(((((((........)))))))...,.{{{..,,)))},{{{{(,.((,((.((.((.((.{{.||.}}.}}.)).)).|}.......{{((({..(({,...((((.(((.((((((...((....))...)))))),.((((((((((((..(((((.{.(((,,.((((...))))...))},}),.)))))..).))))))))).))..(((((((((..,{{.((((({{....,|{{{{.....}}.))((((((......,)))))).}))))}}}))))))))).))).)))),..,,..)))).....)))},}}}}|(((((({(,,({,,(((,,(((((((((,,((((((,.......{{{|.,{{{||{{{{{{{{{{,((((((((((((.(((((((((((((((..........))))))))))))))).)))))))))))),{(({(({{({(((((...,,))))).,.||}.|||...((((((((.....)))))))).}))|||{(({(((({{{{|,,,.,},..(((((((....(((((((({{{({{{(,.,,,.{{{||,,,.({(((((,((((((((.....)))))))).(((({..(((((....}))))..})))),,...{{{{.{|,,,,,)},}}}}{||,...}}},|{{.(((((..(((({.,{(((...)))))))))..))))).},..((((((((...)))))))),,.,...,}}})}..}}}}}.,,|,.....||,,{{,.,,||||,,...,},}}}},...,,}}}},,))}))))))}}))...))))))),}||||..{(((({,(,.........,,,,,,..........}}}))}}}}}||..{..((((((....))))))..}|{{{|||{,{{{,..,,.||||,|.}},,)},}||..,,{{,.,......,,...{((.((((((...........(((((......))).)).....,...,,,...,,,.,,,,,,..,}))}..,,,)))))).))|,.{||||||||,,....,,...,{{{.......})))),,}},,,,})}}}||||||,...,,|}}}}}},,|,......,}}}}}..,,,({((.((((((({{......,,,{{,..,....|||{,{{((,,.(((.((..{(({....}|||,.}|,|||,,,}}}||}},.........|}}}},}}}})}},...{((((((((((.(((((({{{{{{{,,||{{{{.....,.........{{.((((......)))).}}............,..,.}}}.,}}}}))}).))))))))))))))))))}.......,}}}}}}}}}}}}}.....{{{{{((.......))))))),,,},})))))),.))),)))))})})}},,}}}))})}},..,,|{((,,{{}}}|||}}}|(((((({{{{(({,.{{{||,,....{(({({,...{(({(((((,,,,,.....})}}))))}|,,.|.||{{{|||||||,,|,{,.{{||(({{,,,,,,.{{(({{{{{{{.{((((((((((((((.{{.{(((((.((.,.((((({(({.(({(({{{((((((((((..,{((({{.((({(((,,,,.{{((((((,{{{,,......}}})))}}))},,.........))}))}}.,}}}}}|(((,((({{,((((((((.(((....))).))))))))(((((............)))))}}}}}}}}}}....,|,||,{,......||||,,||,.({{{{{....)))))}.....,}||....|||||,||,|}}}}}}}}}}},,,,.....|,,.{((((((........))))))}(((..((((((......))))))..)))((((....))))}}}}}}.}}}.,|}))}}...}})))))},{{||{({|{..(((({...})))).}}.)),.,)))},}.))||}}}}}}.))))}.,,||||,|||||}|((((.......))))},,{{....|||||,||.|||,,,,|{||...{,,,,||||....}|}}}.|}}}}...,|}}|,........(((((((........))))))).,.})))|||}...}},,}}}|}}}}})))))))),}{((((({.....{(((((((((((((((,...((((..............)))))))))))))).(((.{{{.(((((......))))).})),))}...)))))))....)))))))..,}}})},,}}},,,.,.....,,}}}}.,,,......,},)}}))},,.}},)}}}|||||}))}}||,,...,}))})})}}|,.}|||||||||||||||.,,,}})).}}}||{||||,....})))))),,,,,.})))))...)))))))))))))).)))))))))))))||{{|{,..,{{{|{{,|||||{.......((((((.((({...}))))))))},|{{,({,.,{,...,,||}.}}}.|}}}}|{(({(...,)))},...,,,},.,,,,},,))))),.....)))))))))))))..))))),})))......)))))))))).......|,,)))}....,..}))}....}}}..))))))...)))))))..)))..))).,.}))}))))},.}}},}},}),))))).))))..,.)))))))).))),..)))))).{.((((..((((((((((((..(((((((..(((((((((.(({((((((((((((((((.(((((((..,,,..((((((......))))))...(((((((.((.(((((..,,.(((((....))))).,.....{(((((....((((........))))..))))))........{{{..{{{{{..,,{{{{.{((({,,{(((...))))}....,,.,,{{{,,........((((((.....)))))).}})))),}),}},}}))),))).......{((((((((.......(((((........))))).......)))))))))))))).)).)))))))(((((.((((.(((((((((.,..(((((((({{(..............))),.}).))))))...,.)))))))))))....................,.((((......)))).........((((.......))))....,|.(((((...(((.((((({......}))))).)))..})))).,....{{..((((((......))))))..}}..{{{,{((|...}))))))).))))).....}}}..))))))).))))(({.,{{..(((.((......)).)))..},,..})||{(((((((...)))))))..,{(((.((((....((((((.....))))))......)))).)))}............}}}},,,........)))))))))))))).)))))))))..,,,,,{|,....,||(|{{{.,,||}..,,.})))}}..,..,.)}}}|||,,.....,|||{{....)))}))))))))))))..)))).}...,((((((((......))).)))))|{{({.(({((((((,{{.{{{({{..((({....}))),.|}}}|,,.},.})))))).})..)).))}.(((((((......)}}}))))..(((((((.........))))))).((((((((.(((.....)))))))))))...{((((((.{((.{{{{....,,}}.,.))}.)))))))......{{{....{{{(((|...,{((((((((...{{{{{....,,,,,,,....}}}}},..}}))))))))))))))...})),,,,)))}},)))),,))))))))))).....(((((........)))))...........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAUUUGCCACGCGCCGCGUCACCGGGCCGCUCCCGGCCUGGGCUCCCGG… 5896 nt 0.4174
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5615 nt 0.4055
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5595 nt 0.4045
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5300 nt 0.4081
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5276 nt 0.4077
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5220 nt 0.4069
AUCCGUGCGCGGAUGUCCCGGCGAGUCCCGGGCUGAAAGAGGCGGCUCC… 5562 nt 0.4044
Showing 51 to 57 of 57 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a DNA-binding transcription factor that activates many muscle-specific, growth factor-induced, and stress-induced genes. The encoded protein can act as a homodimer or as a heterodimer and is involved in several cellular processes, including muscle development, neuronal differentiation, cell growth control, and apoptosis. Defects in this gene could be a cause of autosomal dominant coronary artery disease 1 with myocardial infarction (ADCAD1). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

A review of studies across multiple species, including Drosophila, Aplysia, mice, and rats, synthesized evidence that the transcription factor MEF2 is implicated in synaptic plasticity and is regulated by the MEF2A [Bredy et al. 10.1016/J.Nlm.2011.04.004].