Basic Information

Symbol
MEF2D
RNA class
mRNA
Alias
Myocyte Enhancer Factor 2D Myocyte-Specific Enhancer Factor 2D MADS Box Transcription Enhancer Factor 2, Polypeptide D
Location (GRCh38)
1:156463727-156501266
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005920.4
Sequence length
5912.0 nt
GC content
0.5673

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2321.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2419.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1439.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271629.2 NCBI
AUACCGUGUGCUCCCCUUGGCAAGUCGGUUCCUGUCCCUUAAGCUGAGA… 5765 nt 0.5632
NM_005920.4 NCBI
GAGUUACCUUUGGAGCCCGAAAGGAGGAAGGAAGCAAAAUAUCAACAAC… 5912 nt 0.5673
Summary

This gene is a member of the myocyte-specific enhancer factor 2 (MEF2) family of transcription factors. Members of this family are involved in control of muscle and neuronal cell differentiation and development, and are regulated by class II histone deacetylases. Fusions of the encoded protein with Deleted in Azoospermia-Associated Protein 1 (DAZAP1) due to a translocation have been found in an acute lymphoblastic leukemia cell line, suggesting a role in leukemogenesis. The encoded protein may also be involved in Parkinson disease and myotonic dystrophy. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2012] CIViC Summary for MEF2D Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.