Basic Information

Symbol
MEFV
RNA class
mRNA
Alias
MEFV Innate Immunity Regulator, Pyrin TRIM20 Marenostrin FMF MEF MEFV, Pyrin Innate Immunity Regulator Mediterranean Fever Pyrin MEFV Innate Immuity Regulator, Pyrin PAAND
Location (GRCh38)
16:3240392-3256954
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000243.3
Sequence length
3506.0 nt
GC content
0.5608

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1349.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1404.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 758.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000243.3 NCBI
CUACCAGAAGCCAGACAGCUGGCUCGAGCCUCUCCUGCUCAGCACCAUG… 3506 nt 0.5608
NM_001198536.2 NCBI
CUACCAGAAGCCAGACAGCUGGCUCGAGCCUCUCCUGCUCAGCACCAUG… 3048 nt 0.5344
Summary

This gene encodes a protein, also known as pyrin or marenostrin, that is an important modulator of innate immunity. Mutations in this gene are associated with Mediterranean fever, a hereditary periodic fever syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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