Basic Information

Symbol
MEGF10
RNA class
mRNA
Alias
Multiple EGF Like Domains 10 KIAA1780 SR-F3 Multiple Epidermal Growth Factor-Like Domains Protein 10 Multiple EGF-Like Domains Protein 10 Multiple EGF-Like-Domains 10 CMYO10A CMYO10B CMYP10A CMYP10B EMARDD
Location (GRCh38)
5:127290796-127465737
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001256545.2
Sequence length
7606.0 nt
GC content
0.4340

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2259.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2405.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2392.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256545.2 NCBI
AGACAGAGAAAACCUUGUUCAAGUUUGCAGCAAGUACUUUCCCGGUGCG… 7606 nt 0.4340
NM_001308119.2 NCBI
AGACAGAGAAAACCUUGUUCAAGUUUGCAGCAAGUACUUUCCCGGUGCG… 2466 nt 0.5215
NM_001308121.2 NCBI
AGACAGAGAAAACCUUGUUCAAGUUUGCAGCAAGUACUUUCCCGGUGCG… 2415 nt 0.5246
NM_032446.3 NCBI
AGACAGAGAAAACCUUGUUCAAGUUUGCAGCAAGUACUUUCCCGGUGCG… 7657 nt 0.4336
Summary

This gene encodes a member of the multiple epidermal growth factor-like domains protein family. The encoded protein plays a role in cell adhesion, motility and proliferation, and is a critical mediator of apoptotic cell phagocytosis as well as amyloid-beta peptide uptake in the brain. Expression of this gene may be associated with schizophrenia, and mutations in this gene are a cause of early-onset myopathy, areflexia, respiratory distress, and dysphagia (EMARDD) as well as congenital myopathy with minicores. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.