Basic Information

Symbol
MEGF9
RNA class
mRNA
Alias
Multiple EGF Like Domains 9 EGFL5 Multiple Epidermal Growth Factor-Like Domains Protein 9 Epidermal Growth Factor-Like Protein 5 EGF-Like-Domain, Multiple 5 Multiple EGF-Like Domains Protein 9 Multiple EGF-Like-Domains 9 EGF-Like Protein 5 KIAA0818
Location (GRCh38)
9:120600811-120714470
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080497.3
Sequence length
6300.0 nt
GC content
0.4367

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1915.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2033.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1523.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080497.3 NCBI
AGAGGGAGGUGGCGAUGGUGCGCCCGGUGGCGGUGGCGGCGGCGGUUGC… 6300 nt 0.4367
Summary

Predicted to be located in basement membrane and membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans developed a targeted RNA sequencing protocol to predict the time-of-day of bloodstain deposition using 69 candidate mRNA markers [Gosch et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103287].