Basic Information

Symbol
MEN1
RNA class
mRNA
Alias
Menin 1 Menin SCG2 Multiple Endocrine Neoplasia I MEAI
Location (GRCh38)
11:64803510-64811294
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370259.2
Sequence length
2712.0 nt
GC content
0.6077

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1058.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1106.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 947.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001407145.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGUGGGCGAGGG… 2783 nt 0.6094
NM_001407146.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGUGGGCGAGGG… 2768 nt 0.6095
NM_001407147.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGUGGGCGAGGG… 2931 nt 0.6124
NM_001407148.1 NCBI
AGAAGCCACAGCGCAGCGGCCCGGCCCGCCACUAUUUCCAGGCUCAGCG… 2626 nt 0.6074
NM_001407149.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGCCGCCGCCCACCGCCCGCCGCC… 2595 nt 0.6058
NM_001407150.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGUGGGCGAGGG… 3099 nt 0.6086
NM_001407151.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGCCGCCGCCCACCGCCCGCCGCC… 2721 nt 0.6020
NM_001407152.1 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGCCGCCGCCCA… 2547 nt 0.6062
NM_130799.3 NCBI
AGAAGCCACAGCGCAGCGGCCCGGCCCGCCACUAUUUCCAGGCUCAGCG… 2731 nt 0.6089
NM_130800.3 NCBI
GUGCGCCGCGGUGCCUAGUGUGGGAUGUAAGCGCGGAGGCCGCCGCCCA… 2727 nt 0.6076
Showing 11 to 20 of 24 entries
Summary

This gene encodes menin, a tumor suppressor associated with a syndrome known as multiple endocrine neoplasia type 1. Menin is a scaffold protein that functions in histone modification and epigenetic gene regulation. It is thought to regulate several pathways and processes by altering chromatin structure through the modification of histones. [provided by RefSeq, May 2019] CIViC Summary for MEN1 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that sarin-induced seizure onset triggers significant transcriptional changes in the piriform cortex, with MEN1 being up-regulated, peaking at 6 hours in microarray analysis and at 3 hours in multiplexed PCR validation [Spradling et al. DOI:10.1186/1742-2094-8-83].