Basic Information

Symbol
MEOX1
RNA class
mRNA
Alias
Mesenchyme Homeobox 1 MOX1 Homeobox Protein MOX-1 Mesenchyme Homeo Box 1 KFS2
Location (GRCh38)
17:43640389-43661922
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004527.4
Sequence length
2674.0 nt
GC content
0.5262

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-952.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -998.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 623.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040002.2 NCBI
AGCCCUCUGCAGGCAUUUGCUCUGGGCUCCAGGACGAACUCCUCGUCAG… 2197 nt 0.5330
NM_004527.4 NCBI
AGCCCUCUGCAGGCAUUUGCUCUGGGCUCCAGGACGAACUCCUCGUCAG… 2674 nt 0.5262
NM_013999.4 NCBI
AGCCCUCUGCAGGCAUUUGCUCUGGGCUCCAGGACGAACUCCUCGUCAG… 2501 nt 0.5218
Summary

This gene encodes a member of a subfamily of non-clustered, diverged, antennapedia-like homeobox-containing genes. The encoded protein may play a role in the molecular signaling network regulating somite development. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human myocardial infarction tissue identified MEOX1 as a key transcriptional regulator in cardiac myofibroblasts within the fibroblast enhancer gene-regulatory network [Kuppe et al. DOI:10.1038/s41586-022-05060-x].