Basic Information

Symbol
MEP1A
RNA class
mRNA
Alias
Meprin A Subunit Alpha PABA Peptide Hydrolase PPHA N-Benzoyl-L-Tyrosyl-P-Amino-Benzoic Acid Hydrolase Subunit Alpha Meprin A, Alpha (PABA Peptide Hydrolase) Endopeptidase-2 EC 3.4.24.18 PPH Alpha BA268F1.1 (Meprin A Alpha (PABA Peptide Hydrolase)) EC 3.4.24
Location (GRCh38)
6:46793368-46839801
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005588.3
Sequence length
2893.0 nt
GC content
0.4739

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-897.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -956.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 690.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005588.3 NCBI
ACUUGCAGCAAUGGCUUGGAUUAGAUCCACUUGCAUUCUCUUUUUUACC… 2893 nt 0.4739
Summary

Enables metallodipeptidase activity. Involved in epidermal growth factor receptor ligand maturation. Located in extracellular exosome. Part of meprin A complex. Is active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans developed a multiplex RT-PCR assay for identifying rectal mucosa as evidence of anal penetration, evaluating six candidate mRNA markers including the MEP1A [Akutsu et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2022.102712].