Basic Information

Symbol
MEST
RNA class
mRNA
Alias
Mesoderm Specific Transcript PEG1 Mesoderm-Specific Transcript Homolog Protein Paternally-Expressed Gene 1 Protein Mesoderm Specific Transcript (Mouse) Homolog Mesoderm Specific Transcript Homolog (Mouse) Paternally-Expressed Gene 1 EC 3.-.-.-
Location (GRCh38)
7:130486171-130506465
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002402.4
Sequence length
2646.0 nt
GC content
0.4618

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-834.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -882.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 751.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001253900.1 NCBI
AAAAGUCGGUGCCCACUCGCUCCGCGCUGCCGCGGCAACCAGCACACCC… 2471 nt 0.4630
NM_001253901.1 NCBI
GGCGCUGACGCCUGGCAGGGAGAAGGCGGCAGCACAUGCUGGGCUCGGG… 2350 nt 0.4409
NM_001253902.1 NCBI
CGGUUCUCCGAAACAUGGAGUCCUGUAGGCAAGGUCUUACCUGAAUCAG… 2302 nt 0.4357
NM_002402.4 NCBI
UGCCGCGGCAACCAGCACACCCCGGCACCUCCUCUGCGGCAGCUGCGCC… 2646 nt 0.4618
NM_177524.2 NCBI
GGCGCUGACGCCUGGCAGGGAGAAGGCGGCAGCACAUGCUGGGCUCGGG… 2452 nt 0.4458
NM_177525.2 NCBI
GGGCGCUGCUGUGGCCAGGCGUCUGGCAUGCUGACCACGUCGCGCUGCU… 2389 nt 0.4374
Summary

This gene encodes a member of the alpha/beta hydrolase superfamily. It is imprinted, exhibiting preferential expression from the paternal allele in fetal tissues, and isoform-specific imprinting in lymphocytes. The loss of imprinting of this gene has been linked to certain types of cancer and may be due to promotor switching. The encoded protein may play a role in development. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been identified for this gene. Pseudogenes of this gene are located on the short arm of chromosomes 3 and 4, and the long arm of chromosomes 6 and 15. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.