Basic Information

Symbol
ABI2
RNA class
mRNA
Alias
Abl Interactor 2 AblBP3 ArgBPIA SSH3BP2 ABI-2 AIP-1 ABI2B Arg-Binding Protein 1 Abelson Interactor 2 ArgBP1 Abl-Interacting Protein 1 (SH3-Containing Protein) Arg Protein Tyrosine Kinase-Binding Protein Abl-Interactor Protein 2b Abl Binding Protein 3 Abl-Binding Protein 3 Abl-Interactor 2 ArgBPIB ARGBPIA Abi-2 AIP1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_001375670.1
Sequence length
6567.0 nt
GC content
0.4212

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1895.58 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2022.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1430.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((......((((((((..(((..((((((((((.(((((((.(((...))).)).)))((((...))))..(((((((.....))).)))).)).))))))))))...)))..))))))))...(.(((((((((.(.(((((((....(((((.(...).))))).))))))).))))).......))))).).(((....)))....((((((................)).))))....(((((((((((.(((((..(((((((..((((((((...............(((((((....((.....))....)).)))))..(((..((((((.((((((((((..((.((((((((((..(((......((((((.........(((((((.............((..(((((...(((((((.((((....(((((((.......))))))).......)))).................(((((((((((((....((((.....))))(((((.((((((....(((.....)))...))))))))))).)))).).))))))))..(((.((((((.........)))))).)))...((((...((((((((((((..(((((...................((((((..((((((((......)))...)))))....))).)))............((.((((((((..........))))))))))..........)))))...)))))).))))))..))))(((.((((((((.......))))))))..)))((((.........))))..........(((((((..((((.(((((((((((((..((...((((((.((((((((((..(..(((...(((((((((((((.(.(((((.......((..((....))..)).......(((((......(((((....)))))....))))).......))))).)))))))))))))).)))..).))))......)))))).))))))))..)))))))))))))))))...)))))))(((((....)))))...(((((((((.((..((((.....(((((...((((.(((((((((.((.....((((((....))))))..((((........))))(((((((((((..((.((...(((((.......)))))...)).)).(((((((.(.(((((...((((..(((...............)))...))))...))))).)...)))))))((((..((((((.((((((((..(((..((((((...((((((.((((((((....))))))))....)))))).(((((((((.((((((......((((((((..(((((((((..((.((......((((((((((((((((.((..((((((((.(((((((((((.((...........)).))))))))....((((((......))))))..(((((...((((.((((((....(((((...))))).(((..((((......((.((((((.....)).))))))......))))..)))......)))))))))).)))))((((((......(((((........))))))))))).)))..).)))))..))..)).))).))))))..)))))))(((((((((....((((((((((((((..((..((((..((((.((((...)))).))))..))))(((((.......(((((((..(((...))))))))))((((((......)))))).....((((.(((((((....(((((((.........(((((((((((((........))))....))))).))))..((((.(((.((.(((((((..............))))))).))..))).))))(((((((((.........(((((((....)))...))))..(((...((((.....))))...)))..........(((.(((((.((..(((((((......(((((((((..(((.....)))..((((((((((............((((...))))((((.((((.....)))).))))....(((.((((....)))).)))))))).)))))..((((((((((((((((............))))))))))).................(((((....(((((((((((.......((((.((.......))))))............(((.((((((.(((.((((....)))).......))).)))))).))).((((...((((((((.(((.(((.......))).)))))))..))))....)))).((((((.......((...(((((((((....)))))))))....)).......((((....))))))))))(((....)))..(((((((((.((((((.........)).)))).))))).)))).)))))))))))..)))))..)))))....))))))))).....))))))).)).))))).))).....(((((.......))))).((((...((((((((.............))))))))...)))))))))))))..........))))))))))))))...))))(((((((((((((((.(((...))))))))))).))..)))))..(((....))).(((.(.(((((((((((.....))..))))))))).)))).........(((.((((.....)))))))((((((((...((((......)).))...))))))))..)))))))..))))))).))))))).....(((((((((((.(((((..............(((..............)))...((((..(((........)))..))))......((((((....))))))....))))).............(((((((((((((((((.....((((((((((.......))))).)))))((((((...(((((((.((((((........(((((((.....))))))).....(((((.(((((......))))).))))).......)))))))))(((.(((((.(((((.((((.((.((((...((.(((((...)))))))..))))..)).)))).))))))))))..)))))))..))))))))))).)))))...)))))))))))))))))).......((((((......))))))(((((((........)))))))...(((((((..(((((((.(((.(((((.(((........((((((....(((((...((.(((((((......))))))).))..)))))....)))))).((((((((((((((((.......(((((((........)))))))..))))))..))))).....)))))...((((((((....(((((...((((....((....))..))))............))))).....)))))))))))...)))))))).))))).)))))))))...((..(((((.(((.(((((...(((((((......(((.((....)).)))...((((.((((((.((((((...((((((((((......((..(((((..(((..(((...)))..)))..)))))))))))))))))..(((((.((((((.((((.(((((.......))))))))))))))).)))))))))))...)))))).)))).)))))))..))))))))...)))))))......))))))))).((((((((..((..(((....)))..))..)))))).))...)).))..))))).))))..)).)))))).......))).)))....)))))).))).((((......))))....................(((((((((..((((.....))))....).))))))))...))))))..)))))))))))...))))))..))))))))))).((.(((((((.((((....)).)))))))))..)).))))((((...((((.....................................))))..))))........)))))))).)))...))))......))))))))))).)))))))))..)))))))..)))))..))((((((.....))))))((((((....).)))))))))))).........)))))))))))))))))))))..)))).))))).).)))))).)))........................))).)))))..)))))...........))..))))))))))))))))..................(((((((..........))))))))))))))))(((((.((((.(((((((((((((((....(((.(((...((((((((((((((.........))))))))).)))))...))).))).((((.(((((((.(((((...........((.((((((..........)))))).))..((((((((((.((((...........)))).))))).)))))((((((((((((((((((....(((..((..(((....(((.((((....((((((((.((((.........((.((((((((..(.((.(((((((...))))))))).)))...........))))))))..........)))).)))).))))....)))).)))...))).))..)))....)))))))))))...)))))))....((((((((((.(..(....)..)))))))))))....)))))))))))).))))...(((((......)))))....((((((((...(((.....))).......)))))))).(((((......))))).(((((....((((...((((((.....((((((((..((((.((((((((((((((((((((.(((.((((.(((((..((((((.((((................(((.((((((...)))))).))).(((((((((((..(((((..........))))))))............(((((..(((.((.........)).)))..)))))((.((((((.....)))))).))...(((((((......)))))))((((((..(((((((..((((...............))))..)))))))........(((((((((((..((((......((((((((((...........................))))))))))......))))...))))))))))).)))))).))))))))....)))).))))))..))))).)))).))).)))......))))))))((((((((...(((((((.....)))))))(((.((.....)).)))..((.((......)).)).....((((((((.....)))))))))))).))))(((((((...)))))))(((((((.((((.......((((((.(((....)))))))))))))))))))).(((((((.....(((((((((..(((((...((((..(((((((..((((((((((((((.((((((((........................))))))))..........((.((((((.(......).)))))).)).(((((.....)))))...........)))))))........((((((.((((......((.(((..(((...................)))..))).)))))).)))))).(((((((.....))))))))))))))..))).))))...))))....)))))(((((((((((((((((.((.((((..((((.((((................((((....))))..)))).)).))..))))....)))))))))).....)))))))))..)))))).)))......)))))))......................)))))))))))))((((((..........(((.....((((.((((((((((((((...........))))))))......(((((.....(((((........)))))...))))).....))))))))))...)))...))))))...((((((..((((.........(((((((....))))))).(((((........)))))))))..)))))).(((..(((((......))))).)))))))))))...))))))...))))...))))).........((((....)))).(((((((..(((....)))...))))))))))))))).........((((((......))))))................((((((...((((.(((........))).))))))))))..)))))))..........)))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((....,.((((((((..(((..((((((((((((({.,,,,|||...}},,(({({.,..),,)))}|..(((((((,...,))).)))),))})))))))))),..)))..)))))))).|.{.(((((((((.(.(((((((....(((((.(...).))))).))))))).))))).......))))).}.(((....))).,,,((((..,.............,})).)))),{{.(((((((((((.(((((,{(,(((((..((((((((..........,,,.,(((((((....,{.....}}....)),,)))}..|{{..((((((.((((((((((..((.((((((((((,.{((......((((((.........{{(((((...,{{|||,,.,{{,....,,|..{((((,..((((.,..(((((((.......))))))).......}}}}..,,.,...........(((((((((((({....((((.....))))(((((.((((({....,{(,,......,,,))))))))))).}))).).)))))))).,{((.((((((.........)))))),)}},..((({...((((((((((((..(((((................,..((((((..((((((((......)))...)))))....))).)))............{{.((((((((..........)))))))))}.......,..)))))...})))))},)))))..}))){{{.((((((((.......)))))))).,)))}||}}}},,,,.,}},.......,,..(((((((((((((.(((((((((((((..((...((((((.((((((((((..{..(((...(((((((((((((.(.(((((.......{(..((....))..)}.......,{((((,,...(((((....)))))....}}}))}},,...))))).)))))))))))))).)))..,.))))}.....}))))).))))))))..)))))))))))))))),...))))))))))(({{{.,,,,,}}))},{{{{{,|(({|{(({.,,.|{{{,....,,||}|{,(((((({(({({((((((((....))))))..,.,...{{{{.{|,.|{..(((((..,{{(({({{{{(((((.......))))(((((((((((((((((.{.(((((,{,((((..{((...............))}...)))),}.))))).}...)))))))((((..((((((.((((((({.,(((..((((((.,,(({{((.((((((((....))))))))....))))}}.{((((((((.((((((......((((((((,.(((((((((..({.((.,{.,.(((((({(((((((((.((..{{(((((,((((((((((((.((...........)).))))))))...,((((((......)))))),.{((({.,.((({{{{((((,,....||||,{|},||,((({.((((.....,({{(((({{....,)),))}}}}....,.}})),|)}},|}}},)))))))))).))))}((((({.,...,((((({.....},))))))))))),))}.,).)))))..}}..)).))).))))))..})))))){((((((((....((((((((((((((.,((({((((,.{(((,((((..,||}}.}}||,.}}},,,|}}}}}}},.(((((({.,(((...})))))))))(((((((.......,,,{,{((.(((({,(((({,....,,,.......,,,...})))},,}}})),}}}}})))))))............,{{{{({{,((({{{.((((((((..,.....,...}))))))).||,,}|}{|}},,||,},||},..,,,,,,{{{{,{{,,,,}},...)))}..((({..(((({{{{{|||},,.|||,.......{((((.......))))}{(((({...|,,(((((((({,.(((.....)))..((((({(((({...,|,||...{(({,..}},,((((.((((.....)))).)))).,.((((.((((....}}}}.})))}))}.))))}..((((((((((((((((............))))))))))).........,,..,,,,({(((,...(((({((((((....,,.((((.((.......)))))).}}...}}}}},{((.((((((.(((.((((....)))).......))).)))))).))}.((((,..((((((((.(((.(((.......))).)))))))..))))..,.)))).((((((.......,{.,.(((((((((....))))))))).,..},.......((((....))))))))))(((....)))..(((((((((.((((((.,{.....,)},)))).)))))}}))).,))))))))))}}))})),.)))))....)))))))))..,,,)))))).((((((((({.,,.{{{.,(((((,.((({{{{{..(((({.....|.)))))})))))}..}))}|||}||.|||{{{.,.,,}}})),}}},{{{{{{{,||||}|(((.,....{{(((.,,,,,,,||||},,,.,}))),)))),))})))}}.)))))))))).{(((.(((.(.((((((((({(.....))..))))))))).)))))))}....}||}.{,||.,}}})),)))))),,}}}})))||}}}}.}},}},},,||}}},,})),,}}}})}}..)))))))},)))))).....(((((((((((,((({(,...........,,|,.}},},.........{{,.,.((((..(((........)))..)))).,}},.{{{{{{....}})}}}....}}}}}.............(((((((((((((((((.....((((((((((.......))))).)))))((((((.{.{((,,,{.((((((........(((((((.....))))))).....(((((.(((({......})))).))))).......))))))}}}(((.(((({,(((((.((((.((.((((...{(.(((((...)))))))..))))..)).)))).))))))))))..)))}))),.))))))))))).)))))...)))))))})))))))))).......{(((((......)))))}(((((((........)))))))...(((((((..{{(((((.(((.((((({(((........((((((....(((((...((.(((((((......))))))).))..)))))....)))))).((((({((({,{{{{,..{,,{.(((((((........))))))).})))}}}..})))).....)))))...((((((((....(((((...((({....{{....,}..}))}............))))).....))))))))})),,.)))))))).))))).}))))))))...{{..{{{{{.(((.(((({.,.{{((((,.....}|||.|,....||{||,...((((.((((((.((((((,{{(,{{||||,,.....,(({,(((((..(((..(({...}))..)))..)}))).))))))),,,,..{((((,(((((({((({,(((((.......))))))))))))))).)))))))))))...)))))).))))..,,}}))}.)}))))))...)))))))......))))))))).|{((((((..({..(((....)))..}}..)))))).},...)).))..)))))))))).,)).)))))).......))).)))....))))))},)},(({(......)))}....................(((((((((..((((.....))))....).))))))))...))))))..)))))))))))...))))))..)))).((((.{.((.(((((((.((({....}).)))))))))}})}.)))))))))).)))),,.......,,..................{((((...((({.........}.})).))))),,.,,,...,..,......)))).,)))))}),,,)))))..)})))))}((({,,,})}|(((...,)}..))))).}))}..))))),}},)))))))),........)))))))))))))))))))))..))))},)))).).)))))).)}}........................))).)))))..))))),}}|{{.....)),.)))))))))))))))).}}},..,,,.....,,,(((((((..,....,..))))))))))))))))(((((,(({(,(((((((((((((({....,((.(((...((((((((((((((.,.....,.))))))))).)))))...))).}}}.((((.(((((((((((((...........{({((((((..,.......)))))).))..((((((((((.((((...........)))).))))).)))))((((((((((((((((((....(((..((..(((....(((.((((.,..((((((((.((((.........((.((((((,...{,((,(((((({...})))))))}..............,)))))))),.........)))).)))).))))..,.)))).)))...))).))..)))....)))))))))))...)))))))....(((((((((({(..(....)..)))))))))))....)))))))))))).))))...(((((......)))))..,,((((((((...{{(.....))}.......)))))))),(((((......))))).{{{{{....((((...((((((.....((((((((..((((.((((((((((((((((((((.(((.((((.(((((..((((({.((((....(({{{{{.....(((.((((({...)))))).))).,{{{{,,,..,,,(((((.{......,.)))))|||,,,.,,,.,{,.({{,,..|{,,|||,||||||{{.,|,,..,,|)},}}.,||||,..,,})},}}}}},,.(((((((......))))))),{{{(({.{(({.(({{{,{{....)}.}}}}}.}}}}))}}},..,,,|,,,,,}.(((((((((((..((({..,{,.{{({,,,{{....................,{{{{.....)))))}}}......))))...)))))))))))..||||{,,,,))))),...)))).})))))..))))).)))).))).)))......))))))))((((((((,.,(((((((.....)))))))|((.((.....)).))|..((.((......)),)).....{(((((((.....)))))))))))).))))(((((({...}))))))(((((((.((((.....,{({((((.{{{....)}))})))}}))))))))))|{{{{{{|.,,..(((((((({..(((((...((((..(((({((..((((((((((({({.((((((((,,,,,......,,,,.........)))))))).,.,{...{((((((({({{({,{{,.|{||,,....)}}}..|}})}})}),)}))))))..},))}||||..,,{,.,((((((.((((.....,{,...,{.(((,,,.......,,}}.}}.......,.....)))).)))))}.{{{||||..,,,))))))})))))))..})}.))))...))))....)))))(((((((((((((((((.{(.((((..(({(.((((,{{,.....|,,....,{{{....)}})},)))).)).))..)))).,,.,,)))))))).....)))))))))..)))))).)))......}}}}}},......................))))))))))))){(((({,,,,,..,,.{((..,..((((.((((((((((((((...........))))))))..,,,,{,,{{.{{{{(((,.....,}}}))),...,,}}}},....}))))))))).,.)))..,}})))}...((((((..((((.........(((((((....))))))).(((((........))))}))))..)))))).{{{..{{{||......))))).})}))))))))...))))))...))))...))}}}...,,,...{{{(,,..)))),(((((((..(((....)))...))))))))))))))).........((((((......)))))).............,,.,,,{{|...((((.(((........))).)))),,,,,,..))))))}.......,,.)))).))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6457 nt 0.4152
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6445 nt 0.4174
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6442 nt 0.4156
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6439 nt 0.4154
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6219 nt 0.4129
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6216 nt 0.4128
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6213 nt 0.4130
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6210 nt 0.4129
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6544 nt 0.4202
CCUUCCGAGUUACCGCCGCCGUCGCCGCCGCUCCUCCUCUCCCGGUCCU… 6198 nt 0.4150
Showing 51 to 60 of 88 entries
Summary

Enables several functions, including SH3 domain binding activity; proline-rich region binding activity; and ubiquitin protein ligase binding activity. Contributes to small GTPase binding activity. Involved in several processes, including Rac protein signal transduction; positive regulation of cellular component organization; and zonula adherens assembly. Acts upstream of or within peptidyl-tyrosine phosphorylation. Located in several cellular components, including actin filament; filopodium tip; and lamellipodium. Part of SCAR complex. Is active in adherens junction. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the ABI2 as a potential diagnostic biomarker for sepsis, where it was found to be lowly expressed in the sepsis group compared to normal controls based on RNA sequencing data, with its mRNA expression pattern being consistent with its corresponding protein level [Wang et al. DOI:10.2147/IDR.S380137].