Basic Information

Symbol
MFF
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial Fission Factor C2orf33 GL004 Chromosome 2 Open Reading Frame 33 EMPF2
Location (GRCh38)
2:227325151-227361188
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001277062.2
Sequence length
1921.0 nt
GC content
0.4362

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-549.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -584.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 483.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001277061.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 2174 nt 0.4319
NM_001277062.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 1921 nt 0.4362
NM_001277063.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 1777 nt 0.4282
NM_001277064.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 1762 nt 0.4302
NM_001277065.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 1702 nt 0.4260
NM_001277066.2 NCBI
AGAAGGGGCCAGCCCGCGCCUUUCGCGCUUCUGCCCUGGCCCUCUGCGG… 1590 nt 0.4283
NM_001277067.1 NCBI
GGACAAAAGUGGCUCUCAAUCCAGCACAUGCACAUUGAAGCAAGUUAAA… 1710 nt 0.3877
NM_001277068.1 NCBI
GGACAAAAGUGGCUCUCAAUCCAGCACAUGCACAUUGAAGCAAGUUAAA… 1630 nt 0.3963
NM_020194.5 NCBI
GUUACUUUUUAAAUGGACAAAAGUGGCUCUCAAUCCAGCACAUGCACAU… 2014 nt 0.4012
Summary

This is a nuclear gene encoding a protein that functions in mitochondrial and peroxisomal fission. The encoded protein recruits dynamin-1-like protein (DNM1L) to mitochondria. There are multiple pseudogenes for this gene on chromosomes 1, 5, and X. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013]

Forensic Context

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