Basic Information

Symbol
MFGE8
RNA class
mRNA
Alias
Milk Fat Globule EGF And Factor V/VIII Domain Containing MFG-E8 SED1 Lactadherin HsT19888 OAcGD3S EDIL1 BA46 HP47 Milk Fat Globule-EGF Factor 8 Protein Breast Epithelial Antigen BA46 Sperm Associated Antigen 10 Sperm Surface Protein HP47 SPAG10 HMFG MFGM O-Acetyl Disialoganglioside Synthase Milk Fat Globule-EGF Factor 8 Medin
Location (GRCh38)
15:88898683-88913468
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005928.4
Sequence length
1936.0 nt
GC content
0.5997

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-805.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -839.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 377.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114614.3 NCBI
AGAACCCCGCGGGGUCUGAGCAGCCCAGCGUGCCCAUUCCAGCGCCCGC… 1780 nt 0.6022
NM_001310319.2 NCBI
AGAACCCCGCGGGGUCUGAGCAGCCCAGCGUGCCCAUUCCAGCGCCCGC… 1804 nt 0.6042
NM_001310320.2 NCBI
AGAACCCCGCGGGGUCUGAGCAGCCCAGCGUGCCCAUUCCAGCGCCCGC… 1989 nt 0.5963
NM_001310321.2 NCBI
ACCUCCACUGUUGACAAACUUAGACAAAGCCCCGGGGACCGGGCUGGGC… 2544 nt 0.5939
NM_005928.4 NCBI
AGAACCCCGCGGGGUCUGAGCAGCCCAGCGUGCCCAUUCCAGCGCCCGC… 1936 nt 0.5997
Summary

This gene encodes a preproprotein that is proteolytically processed to form multiple protein products. The major encoded protein product, lactadherin, is a membrane glycoprotein that promotes phagocytosis of apoptotic cells. This protein has also been implicated in wound healing, autoimmune disease, and cancer. Lactadherin can be further processed to form a smaller cleavage product, medin, which comprises the major protein component of aortic medial amyloid (AMA). Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MFGE8 was differentially expressed in astrocytes of alcohol-dependent individuals in the prefrontal cortex [Brenner et al. DOI:10.1093/Hmg/Ddaa038]. In primary rat microglia, alcohol exposure altered the expression of the MFGE8 mRNA, which is involved in phagocytosis regulation, and functional assays confirmed alcohol reduced phagocytic activity [Kalinin et al. DOI:10.1186/S12974-018-1184-7].