Basic Information

Symbol
MFSD12
RNA class
mRNA
Alias
Major Facilitator Superfamily Domain Containing 12 C19orf28 SLC59B1 PP3501 Major Facilitator Superfamily Domain-Containing Protein 12 MGC20700 Chromosome 19 Open Reading Frame 28
Location (GRCh38)
19:3538261-3574290
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_174983.5
Sequence length
2137.0 nt
GC content
0.6781

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1053.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1087.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001287529.2 NCBI
GCAGAGUCGAGCGUGGGGCGGACGCGGCGGACGUGGGUGAGGGCGCGGC… 2110 nt 0.6768
NM_174983.5 NCBI
GCAGAGUCGAGCGUGGGGCGGACGCGGCGGACGUGGGUGAGGGCGCGGC… 2137 nt 0.6781
Summary

Enables cysteine transmembrane transporter activity. Involved in cysteine transmembrane transport; pigment metabolic process involved in pigmentation; and regulation of melanin biosynthetic process. Located in lysosome and melanosome. Part of late endosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A review of massively parallel sequencing applications in human forensic genetics notes that the MFSD12 gene is associated with skin color prediction in Native American and East Asian populations [Carratto et al. DOI:10.1590/1678-4685-GMB-2022-0077].