Basic Information

Symbol
MGA
RNA class
mRNA
Alias
MAX Dimerization Protein MGA MAD5 KIAA0518 MXD5 MAX Gene-Associated Protein MAX Dimerization Protein 5 FLJ12634 MGA, MAX Dimerization Protein MAX Gene Associated POF26
Location (GRCh38)
15:41621134-41773081
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001400225.1
Sequence length
12193.0 nt
GC content
0.4323

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3515.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3745.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2965.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080541.3 NCBI
GUCCGGUGCGCGCGCGCAGGCUCUUCAGCUGGAGCGGACACACGGUGUG… 11419 nt 0.4281
NM_001164273.2 NCBI
GUCCGGUGCGCGCGCGCAGGCUCUUCAGCUGGAGCGGACACACGGUGUG… 12046 nt 0.4313
NM_001400225.1 NCBI
GUCCGGUGCGCGCGCGCAGGCUCUUCAGCUGGAGCGGACACACGGUGUG… 12193 nt 0.4323
NM_001400242.1 NCBI
ACUUCCGCGUCGCUCAGCUACCUAACUGGGAACAUCGACGCCAGAGAGA… 9148 nt 0.4236
NM_001400243.1 NCBI
GUCCGGUGCGCGCGCGCAGGCUCUUCAGCUGGAGCGGACACACGGUGUG… 1818 nt 0.4422
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in cell fate specification and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within cellular response to leukemia inhibitory factor. Part of MLL1 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for MGA Gene

Forensic Context

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