Basic Information

Symbol
MGAT5
RNA class
mRNA
Alias
Alpha-1,6-Mannosylglycoprotein 6-Beta-N-Acetylglucosaminyltransferase GNT-V Alpha-1,6-Mannosylglycoprotein 6-Beta-N-Acetylglucosaminyltransferase A MGAT5A Mannosyl (Alpha-1,6-)-Glycoprotein Beta-1,6-N-Acetyl-Glucosaminyltransferase Alpha-Mannoside Beta-1,6-N-Acetylglucosaminyltransferase V Mannoside Acetylglucosaminyltransferase 5 N-Acetylglucosaminyl-Transferase V EC 2.4.1.155 GlcNAc-T V GNT-VA GGNT5
Location (GRCh38)
2:134119933-134454621
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002410.5
Sequence length
8332.0 nt
GC content
0.4838

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2813.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2965.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1974.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371457.1 NCBI
AGAGCCGCGAGCCCAGAAGCGGGGAGAAGUUGGUGAGGUUGGCUAGGGG… 8499 nt 0.4972
NM_002410.5 NCBI
AUAAUUGCUUAGCUUCUUGUUGCCUAGCCAGAUUUCCCCUCAGCUUACA… 8332 nt 0.4838
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the glycosyltransferase family. It catalyzes the addition of beta-1,6-N-acetylglucosamine to the alpha-linked mannose of biantennary N-linked oligosaccharides present on the newly synthesized glycoproteins. It is one of the most important enzymes involved in the regulation of the biosynthesis of glycoprotein oligosaccharides. Alterations of the oligosaccharides on cell surface glycoproteins cause significant changes in the adhesive or migratory behavior of a cell. Increase in the activity of this enzyme has been correlated with the progression of invasive malignancies. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

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