Basic Information

Symbol
MGMT
RNA class
mRNA
Alias
O-6-Methylguanine-DNA Methyltransferase Methylated-DNA--Protein-Cysteine Methyltransferase 6-O-Methylguanine-DNA Methyltransferase O-6-Methylguanine-DNA-Alkyltransferase EC 2.1.1.63 O6-Methylguanine-DNA Methyltransferase Methylguanine-DNA Methyltransferase
Location (GRCh38)
10:129466679-129770983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002412.5
Sequence length
4678.0 nt
GC content
0.5522

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1819.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1896.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1034.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002412.5 NCBI
AACGCUUUGCGUCCCGACGCCCGCAGGUCCUCGCGGUGCGCACCGUUUG… 4678 nt 0.5522
Summary

Alkylating agents are potent carcinogens that can result in cell death, mutation and cancer. The protein encoded by this gene is a DNA repair protein that is involved in cellular defense against mutagenesis and toxicity from alkylating agents. The protein catalyzes transfer of methyl groups from O(6)-alkylguanine and other methylated moieties of the DNA to its own molecule, which repairs the toxic lesions. Methylation of the genes promoter has been associated with several cancer types, including colorectal cancer, lung cancer, lymphoma and glioblastoma. [provided by RefSeq, Sep 2015] CIViC Summary for MGMT Gene

Forensic Context

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