Basic Information
Symbol
MGP
RNA class
mRNA
Alias
Matrix Gla Protein
Cell Growth-Inhibiting Gene 36 Protein
MGLAP
GIG36
NTI
Location (GRCh38)
12:14880864-14887639
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_000900.5
Sequence length
1650.0 nt
GC content
0.3727
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-364.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-395.49 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
342.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUAGGAGCCUCUCUCCCUACUGCUGCUACACAAGACCCUGAGACUGACC… | 1650 nt | 0.3727 | |
| GUAGGAGCCUCUCUCCCUACUGCUGCUACACAAGACCCUGAGACUGACC… | 1725 nt | 0.3774 |
Summary
This gene encodes a member of the osteocalcin/matrix Gla family of proteins. The encoded vitamin K-dependent protein is secreted by chondrocytes and vascular smooth muscle cells, and functions as a physiological inhibitor of ectopic tissue calcification. Carboxylation status of the encoded protein is associated with calcification of the vasculature in human patients with cardiovascular disease and calcification of the synovial membranes in osteoarthritis patients. Mutations in this gene cause Keutel syndrome in human patients, which is characterized by abnormal cartilage calcification, peripheral pulmonary stenosis and facial hypoplasia. [provided by RefSeq, Sep 2016]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.