Basic Information

Symbol
MGRN1
RNA class
mRNA
Alias
Mahogunin Ring Finger 1 RNF156 KIAA0544 Mahogunin Ring Finger 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MGRN1 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MGRN1 Mahogunin RING Finger Protein 1 RING Finger Protein 156 Probable E3 Ubiquitin-Protein Ligase MGRN1 Mahogunin, Ring Finger 1 EC 2.3.2.27 EC 6.3.2
Location (GRCh38)
16:4616493-4690977
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015246.4
Sequence length
3930.0 nt
GC content
0.6193

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1636.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1704.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1073.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142289.3 NCBI
GGGGGCUCGAGGCGCCUCCGCGGCCGUGGACGAGCGUCCGUGCGGCCUG… 3864 nt 0.6214
NM_001142290.3 NCBI
GGGGGCUCGAGGCGCCUCCGCGGCCGUGGACGAGCGUCCGUGCGGCCUG… 6467 nt 0.6204
NM_001142291.3 NCBI
GGGGGCUCGAGGCGCCUCCGCGGCCGUGGACGAGCGUCCGUGCGGCCUG… 6401 nt 0.6216
NM_015246.4 NCBI
GGGGGCUCGAGGCGCCUCCGCGGCCGUGGACGAGCGUCCGUGCGGCCUG… 3930 nt 0.6193
Summary

Enables ubiquitin-protein transferase activity. Involved in endosome to lysosome transport; negative regulation of adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; and protein monoubiquitination. Located in several cellular components, including early endosome; endoplasmic reticulum; and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MGRN1 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption in postmortem prefrontal cortex [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].