Basic Information

Symbol
MIB2
RNA class
mRNA
Alias
MIB E3 Ubiquitin Protein Ligase 2 Skeletrophin ZZANK1 ZZZ5 Zinc Finger ZZ Type With Ankyrin Repeat Domain Protein 1 Zinc Finger, ZZ Type With Ankyrin Repeat Domain 1 Putative NF-Kappa-B-Activating Protein 002N RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MIB2 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MIB2 Novel Zinc Finger Protein Mind Bomb Homolog 2 FLJ39787 Novelzin Mindbomb E3 Ubiquitin Protein Ligase 2 Mindbomb Homolog 2 (Drosophila) Mindbomb Homolog 2 EC 2.3.2.27 EC 6.3.2.13 EC 6.3.2 SKD
Location (GRCh38)
1:1615434-1630610
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001170687.4
Sequence length
3206.0 nt
GC content
0.6875

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1598.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1646.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 772.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170686.4 NCBI
GCCCUUCGGGUCCCACAGUUUCCAGCCGCCGCUCUCCUCAGUGCCCGGU… 3236 nt 0.6891
NM_001170687.4 NCBI
GCCCUUCGGGUCCCACAGUUUCCAGCCGCCGCUCUCCUCAGUGCCCGGU… 3206 nt 0.6875
NM_001170688.2 NCBI
GCCCUUCGGGUCCCACAGUUUCCAGCCGCCGCUCUCCUCAGUGCCCGGU… 3053 nt 0.6911
NM_001170689.2 NCBI
AGCUCCCGGCAGGCCUCGCGCGGCCCGGGGCCAGCGGCGCUGGGGUCGG… 2941 nt 0.6940
NM_080875.5 NCBI
GCCCUUCGGGUCCCACAGUUUCCAGCCGCCGCUCUCCUCAGUGCCCGGU… 3248 nt 0.6881
Summary

The protein encoded by this gene is an E3 ubiquitin protein ligase that mediates ubiquitination of proteins in the Notch signaling pathway. The encoded protein may be a suppressor of melanoma invasion. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue identified the MIB2 as a protein-coding gene up-regulated within an alcohol-responsive module in the frontal cortex of individuals with alcohol use disorder [Warden & Mayfield 10.1016/J.Neuropharm.2017.02.017].