Basic Information

Symbol
MID1
RNA class
mRNA
Alias
Midline 1 TRIM18 RNF59 FXY OS RING-Type E3 Ubiquitin Transferase Midline-1 Tripartite Motif-Containing Protein 18 E3 Ubiquitin-Protein Ligase Midline-1 Putative Transcription Factor XPRF RING Finger Protein Midline-1 RING Finger Protein 59 Opitz/BBB Syndrome XPRF Zinc Finger On X And Y, Mouse, Homolog Of Tripartite Motif Protein TRIM18 Midline 1 RING Finger Protein EC 2.3.2.27 BBBG1 GBBB1 MIDIN ZNFXY Midin GBBB OGS1 OSX
Location (GRCh38)
X:10445310-10833654
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000381.4
Sequence length
6168.0 nt
GC content
0.4334

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1712.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1832.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1716.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000381.4 NCBI
GAGAACUGAUUUGAAAUAAGAGCCAGGCGGUCCUCGCUUCCCUGCGACC… 6168 nt 0.4334
NM_001098624.2 NCBI
GAUUCUAUGCAGGGUCACUAUGAAAGAGGCAGCCUGCCCCAGUUUGGGU… 6393 nt 0.4245
NM_001193277.1 NCBI
ACAGACACACAGGACCGCUCCAGCACUGCCUGCCACCCACCGUCUGGUC… 6252 nt 0.4263
NM_001193278.1 NCBI
AUAGCUGAUCAGCUUCCUUGGGUUUUGCUGAUGACACAAGAGAGCUUUG… 1926 nt 0.4611
NM_001193279.1 NCBI
AUAGCUGAUCAGCUUCCUUGGGUUUUGCUGAUGACACAAGAGAGCUUUG… 1773 nt 0.4619
NM_001193280.1 NCBI
AUAGCUGAUCAGCUUCCUUGGGUUUUGCUGAUGACACAAGAGAGCUUUG… 1659 nt 0.4599
NM_001347733.2 NCBI
GAGCUCGGCUCUUGAGACAGGAGUCUUGCUGAUGCCUCUGGCCAAAUAA… 6492 nt 0.4321
NM_033289.2 NCBI
GAGAACUGAUUUGAAAUAAGAGCCAGGCGGUCCUCGCUUCCCUGCGACC… 6300 nt 0.4276
NM_033290.4 NCBI
AUUCAGCUGAUCCGAGGCAAAGAGCCGGCACUUGCCCCAGCCCAGCCUG… 6248 nt 0.4257
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family, also known as the 'RING-B box-coiled coil' (RBCC) subgroup of RING finger proteins. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein forms homodimers which associate with microtubules in the cytoplasm. The protein is likely involved in the formation of multiprotein structures acting as anchor points to microtubules. Mutations in this gene have been associated with the X-linked form of Opitz syndrome, which is characterized by midline abnormalities such as cleft lip, laryngeal cleft, heart defects, hypospadias, and agenesis of the corpus callosum. This gene was also the first example of a gene subject to X inactivation in human while escaping it in mouse. Alternative promoter use, alternative splicing and alternative polyadenylation result in multiple transcript variants that have different tissue specificities. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MID1 (Mid1) showed differential hnRNP H1 binding and was significantly upregulated in gene expression in the striatum in response to methamphetamine administration [Ruan et al. DOI:10.1016/J.Pnpbp.2025.111598].