Basic Information

Symbol
MIDN
RNA class
mRNA
Alias
Midnolin Stx Midbrain Nucleolar Protein Stuxnet Homolog (Drosophila) Stuxnet Homolog
Location (GRCh38)
19:1248331-1259145
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001388306.1
Sequence length
3892.0 nt
GC content
0.6272

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1657.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1727.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1184.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001388306.1 NCBI
AGACCGGCCCGGCCAGCGCGCAUUCGGCCCCGGACGAAGGUACUCGCAG… 3892 nt 0.6272
NM_001388307.1 NCBI
AGACCGGCCCGGCCAGCGCGCAUUCGGCCCCGGACGAAGGUACUCGCAG… 3760 nt 0.6250
NM_001388474.1 NCBI
AGAUCCUCCGAGCGGCGGCGACGGCUGUUGCUAAGGGAGGGGACGCGCG… 3687 nt 0.6225
NM_177401.5 NCBI
AGACCGGCCCGGCCAGCGCGCAUUCGGCCCCGGACGAAGGUACUCGCAG… 3763 nt 0.6250
Summary

Enables molecular adaptor activity. Involved in proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process. Located in cytoplasm and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MIDN transcript increased within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267], while in zebrafish its transcript increased at 0.3 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267]. In a separate investigation of rhesus macaques with hypertrophic cardiomyopathy, the MIDN gene was identified as an upregulated differentially expressed transcript in affected animals [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].