Basic Information

Symbol
MKNK1
RNA class
mRNA
Alias
MAPK Interacting Serine/Threonine Kinase 1 MNK1 MAP Kinase-Interacting Serine/Threonine-Protein Kinase 1 MAP Kinase Interacting Serine/Threonine Kinase 1 MAP Kinase Signal-Integrating Kinase 1 MAPK Signal-Integrating Kinase 1 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11 Mnk1
Location (GRCh38)
1:46557407-46616843
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135553.4
Sequence length
2661.0 nt
GC content
0.5212

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-932.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -983.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 670.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135553.4 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2661 nt 0.5212
NM_001377337.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUUUCCA… 2720 nt 0.5129
NM_001377338.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2762 nt 0.5170
NM_001377341.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUUUCCA… 2676 nt 0.5112
NM_001377342.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2718 nt 0.5155
NM_001377343.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUUUCCA… 2477 nt 0.5168
NM_001377373.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUUUCCA… 2619 nt 0.5170
NM_001377374.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2617 nt 0.5197
NM_001377375.1 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2637 nt 0.5199
NM_003684.7 NCBI
CUAGCACCGCCUCUUCCGCGUUCUCGGAGGAGCGAUCUGCAGGUAGGGG… 2784 nt 0.5248
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a Ser/Thr protein kinase that interacts with, and is activated by ERK1 and p38 mitogen-activated protein kinases, and thus may play a role in the response to environmental stress and cytokines. This kinase may also regulate transcription by phosphorylating eIF4E via interaction with the C-terminal region of eIF4G. Alternatively spliced transcript variants have been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in humans identified the MKNK1 as one of the top 10 hub genes in a sepsis-related co-expression network [Jiang et al. DOI:10.1038/s41435-024-00293-4]. Another human study investigating cardiovascular disease progression identified a long non-coding RNA, MKNK1-AS1, which is co-expressed with IL1R2 and may play a crucial role in the development of acute myocardial infarction, myocardial fibrosis, and heart failure [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044].