Basic Information

Symbol
MLEC
RNA class
mRNA
Alias
Malectin KIAA0152 Oligosaccharyltransferase Complex Subunit (Non-Catalytic)
Location (GRCh38)
12:120687125-120704282
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014730.4
Sequence length
6341.0 nt
GC content
0.4941

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2269.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2387.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1671.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303627.2 NCBI
AGUGUGUGUCAGAAUUGCCAGGGCAGCUGGUUAAAAAUGCAGAUUCCUA… 6083 nt 0.4781
NM_001303628.2 NCBI
GUGGCUGAGAAGAAGGAGGCCUGAGAGCGACAUGUCCCCGGCGGCUCAG… 6106 nt 0.4946
NM_014730.4 NCBI
GUGGCUGAGAAGAAGGAGGCCUGAGAGCGACAUGUCCCCGGCGGCUCAG… 6341 nt 0.4941
Summary

This gene encodes the carbohydrate-binding protein malectin which is a Type I membrane-anchored endoplasmic reticulum protein. This protein has an affinity for Glc2Man9GlcNAc2 (G2M9) N-glycans and is involved in regulating glycosylation in the endoplasmic reticulum. This protein has also been shown to interact with ribophorin I and may be involved in the directing the degradation of misfolded proteins. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Forensic Context

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