Basic Information

Symbol
MLLT3
RNA class
mRNA
Alias
MLLT3 Super Elongation Complex Subunit YEATS3 AF9 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia Translocated To Chromosome 3 Protein ALL1-Fused Gene From Chromosome 9 Protein YEATS Domain-Containing Protein 3 Protein AF-9 AF-9 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia (Trithorax Homolog, Drosophila); Translocated To, 3 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia (Trithorax Homolog); Translocated To, 3 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia; Translocated To, 3 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia; Translocated To 3 KMT2A/MLLT3 Fusion Protein
Location (GRCh38)
9:20341669-20622499
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004529.4
Sequence length
6724.0 nt
GC content
0.3797

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1723.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1862.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1887.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286691.2 NCBI
GCUCACACGCGCGCACUCACACACACACACACACACGGUGGAAGGAGGC… 6635 nt 0.3789
NM_004529.4 NCBI
AAUCAUCUUCUUUACCCUGGAGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUUUUGCUU… 6724 nt 0.3797
Summary

Enables chromatin binding activity; lysine-acetylated histone binding activity; and molecular adaptor activity. Involved in several processes, including hematopoietic stem cell differentiation; positive regulation of DNA-templated transcription; and regulation of stem cell division. Acts upstream of or within negative regulation of canonical Wnt signaling pathway and positive regulation of Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway. Located in cytosol and nucleoplasm. Part of transcription elongation factor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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