Basic Information

Symbol
MMP16
RNA class
mRNA
Alias
Matrix Metallopeptidase 16 MT3-MMP C8orf57 Matrix Metallopeptidase 16 (Membrane-Inserted) Membrane-Type Matrix Metalloproteinase 3 Membrane-Type-3 Matrix Metalloproteinase Matrix Metalloproteinase-16 DKFZp761D112 MT-MMP 3 MMP-X2 MMP-16 MT3MMP MTMMP3 Matrix Metalloproteinase 16 (Membrane-Inserted) Putative Transmembrane Protein C8orf57 Chromosome 8 Open Reading Frame 57 EC 3.4.24.80 EC 3.4.24.- EC 3.4.24 MT-MMP2 MT-MMP3 MMPX2
Location (GRCh38)
8:88032011-88328025
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005941.5
Sequence length
11551.0 nt
GC content
0.3638

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2939.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3172.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3114.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005941.5 NCBI
GAGCCGGAACCGCCGGUGAACUUAGGCGCCACGUUCCCGGUGACUGACC… 11551 nt 0.3638
Summary

Proteins of the matrix metalloproteinase (MMP) family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. Most MMP's are secreted as inactive proproteins which are activated when cleaved by extracellular proteinases. The encoded protein activates MMP2 by cleavage. This gene was once referred to as MT-MMP2, but was renamed as MT-MMP3 or MMP16. [provided by RefSeq, Oct 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MMP16 mRNA, relevant to lung fibrosis, was upregulated by 12 Gy of whole-body irradiation in lung tissue harvested 48 hours post-exposure [Aryankalayil et al. DOI:10.1080/09553002.2023.2214205].