Basic Information

Symbol
AQP6
RNA class
mRNA
Alias
Aquaporin 6 AQP2L Kidney-Specific Aquaporin Aquaporin-6 AQP-6 HKID Aquaporin 2-Like, Kidney Specific Aquaporin 6, Kidney Specific Aquaporin-6, Kidney Specific Aquaporin-2-Like KID
Location (GRCh38)
12:49967194-49977139
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001652.4
Sequence length
2544.0 nt
GC content
0.5751

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1058.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1103.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 538.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001652.4 NCBI
AUACACAUGCAUAAGCCCAUCCGCCUGCGCCCUGCCAGUCUGACCAGCA… 2544 nt 0.5751
Summary

The protein encoded by this gene is an aquaporin protein, which functions as a water channel in cells. Aquaporins are a family of small integral membrane proteins related to the major intrinsic protein (MIP or AQP0). This protein is specific for the kidney. This gene and related family members AQP0, AQP2, and AQP5 reside in a cluster on chromosome 12q13. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in Wistar rats demonstrated that severe scald injury induced synchronized increases in myocardial water content and the expression of the AQP6, with levels peaking at 12 hours post-injury [Li et al. DOI:10.3906/sag-1401-149].