Basic Information

Symbol
MNS1
RNA class
mRNA
Alias
Meiosis Specific Nuclear Structural 1 SPATA40 Meiosis-Specific Nuclear Structural Protein 1 Spermatogenesis Associated 40 FLJ11222 HTX9
Location (GRCh38)
15:56421544-56465168
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018365.4
Sequence length
2030.0 nt
GC content
0.3847

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-427.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -468.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 642.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018365.4 NCBI
ACUUUUGGUCGAGCGGAGGGCGCGCAGCUCCACCGUUGCCAAGACGCCG… 2030 nt 0.3847
Summary

This gene encodes a protein highly similar to the mouse meiosis-specific nuclear structural 1 protein. The mouse protein was shown to be expressed at the pachytene stage during spermatogenesis and may function as a nuclear skeletal protein to regulate nuclear morphology during meiosis. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MNS1 gene was downregulated in the lungs as part of the inhibited cell cycle pathway in sepsis patients [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].