Basic Information

Symbol
MORC3
RNA class
mRNA
Alias
MORC Family CW-Type Zinc Finger 3 NXP2 KIAA0136 ZCWCC3 ZCW5 Zinc Finger CW-Type Coiled-Coil Domain Protein 3 Zinc Finger, CW Type With Coiled-Coil Domain 3 MORC Family CW-Type Zinc Finger Protein 3 Nuclear Matrix Protein 2 Zinc Finger, CW-Type With Coiled-Coil Domain 3 Nuclear Matrix Protein NXP2
Location (GRCh38)
21:36320189-36386148
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015358.3
Sequence length
4224.0 nt
GC content
0.3712

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1038.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1121.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1217.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((.(..(((....)))..).))))))(((((((..(((((..((.((.((((......))))))))))))).....((((...(((......))).....)))).(((.(((((((.((...((....(((.....(((...(((((((......)))))))...))).....)))...))...))))))))).)))..........(((...((((....((((((...(((((.....((((..(((((.((......))))))).......((((((((...........(((((..(((((((((((.(((((...))))).......((((((.(((((..((...))..))))))))))).(((((.(((((...(((((((......)))))))...((((((.(((....))).)))))).((((((.........)).)))))))))))))))))))))...))))..))))).(((((((.......(((((.(((...(((..((((..(((((((..................(((((.(((.(((...((((((((.((.....)).))))).))).))))))...)))))....(((..((((......))))..)))........)))))))..))))...))).))))))))......))))))).((((...........))))........)))))))).((((....((((.....))))....))))((((((.(((((.((((((.((((((((((((((((((((((((.((.(.((....))))).)))((.....)).....................((((((((((((.......((((((.....(((....)))((((((((((..((..(((((...(((((......))))).......(((((((((((((........))))))))....)))))..(((.(((((((......(((((((((......)))))).))).(((((....((((((((...((((((.....((((..((((.......))))..))))...((((((((((((((((((((((((...)))))))))....)))).))))...................((.((((....)))).))...........))))))).(((((((((((..........((((.(((((.((..........((((..(((......)))..))))((.(((((..((.((((((.(((((..(((((.(((((((((((((.(((((..(((((......)))))..))))))))).((((((.(((((..((((.(.....(((((((...)))).)))......(((((((....)))))))((((((.....)))))).....).)))).))))).)))))))))))))..................((.....)).........((((((............)))))).)).))))))))))...))).))).))...))))))))))))))..)))))))))))))))((((...(((((((((.......)))).)))))...)))).....(((((..(((((.((((((...........(((((((...((((((.......))))).)....))))))).....(((((..(((((((.((.((.(((((........))))).)).)).)))))))..))))).....((((((((.....((((..(((((((((......))))))))).........................((((((((..(((((.......))))).......(((((.(((..(((((((......)))))))..))).)))))(((((....((((((..((......)).)))))).....))))).....((((..........))))..)))))))).)))).)))))))).....)))))).))))).....)))))....(((((........))))).))))))...))))).)))..)))))...(((((((((...((....)).....)))).......))))).............))))))).))).(((...)))......))))).))..))))))))))..(((((......)))))....................((((((...((((((((...........))))....))))...)))))).....(((.((.(((((.(.((....)).).))))).))))))))))).......))).)))))))))((((....)))).....))).))))))...)))))((((...(((((((((((((.(((((((((((............))))))..........(((((....)))))((((....((((((...(((((((....((((.....................)))).....))))))).))))))....))))((((((....))))))(((((((.(.(((.(.((((((((.........(((((((....((((..((((((...........))))))..))))((((((((((((....))).(((((..........)))))..((((((..(((.((((((((((....)))))...((((.((((((((((((((.....)))))).((((...........))))...)))))))))))).(((((..((..((((((....((((......)))).......))))))..))..))))).))))).))).))))))(((((((((((.((((((....)))..((((((....(((((.(((((...)))))...((((.....))))......((((((((.((...((((.(((((.(((((((((((((................((.((((((((..((((...((.........))....))))..))))).))))).((((((..(((((...)))))..))))))...)))))))))))))...)))))))))...)).))))))))))))).....))))))...((......))....((((((.((((........)))).)))))).....))).)))))))).)))....)))))))))..(((((((...(((.....))))))))))...)))))))..))))))))))))).)))))))..(((......)))(((...)))...(((((((.((((((((((..((((((((.(((((((.((((((....(((((......................)))))....))))))..))))))).))))))))...)))))))))))))))))........((((((...(((((((((......))))))))).((((((..........))))))))))))..))))))))))))).))))).....))))((((((...))))))........((((((.....))))))..........((((((((((.((((.(((.((((((.(((.(((....((((.......))))....))).))).))..)))).)))..)))).))))))))))))))))).))...)))).)))))..))))))((((.....))))((((..((((.((((((((((((...)))))))))......)))))))))))......((((((.((.((((((.........((((.......)))).........)))))).)).))))))..(((((((.(((((((..(((((((((((..((((.((((...........)))).))))..((((..((.(((((.....))))).))..)))).((((((((........))))))))......((((((((.((((................................(((((.........)))))..((((((((((.....))))))).)))...(((((((((.........)))))))))..)))).))))))))(((((((((...........)))))))))))))))))))).........)))))))))))))))))))))))...))))))..))))....)))...((((((..(((...)))..))))))..........)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((((((((((.(..(((...,|||,.|,|||}||((({({{{{((({|.,((.((,((({.....,||}}}}},})))},...,||}},.,|||}}}.}}}}}|,,,||}}},{((.{{{{{{{.,{...{{,...{((,,...{{(,,.(((((((.....,)))))))...}}}...,,|||,{,||.{{||||}||||.|||,..,,.,{,{{{{{{,.,....,,}}.,...{{{{||||,|{|{..,..(((((.((,....,))))))),{{{{,.,,,{{.....,,,,,....,,{{{({{{.,,,))}}..(((((...)))))}}}),}}}})))),(((((..{,...,}..))))),|}))||||,||}|||,|}..{((((((......))))))}...((((((.(({....))).)))))),}||||||,||,|,..,|,}}}})}))}))}|||}||||||....,(((.((.(((((.{({,{(,....}))}},.))))).)).}}}.,.,||||||.,,,,.,{{{|||},.,{((((({.,({((({{{((((((..{(({{{(((({{{||,.|||{|}},.)},.)))},.{{{(((,.(((,......{||,..{{|(,,.({(({,,,.,|.}}}},..}))}.,..}))........))}.,,||}}}}.{{{{{,...,}}}}.....{,.{{||.,,,{((({..,.{{{{...,,}})}....}}|||...,{|||||,.}}}||||,..}}}}}}..|||||.,((((({.{(.(.,....,))})).})))}..,}}))))),.............((((((((((((,.(({{({,..,,|||{,,...(((....}}}((((((((((..,,,,(((((,,.{(((({....,))))).......{{{{(((((((((........))))))))}...,))))..{{{.(((((({..,...,,,..,,.((((....{.(((((((..........{(((((((...((((((.....{(((,.({((,.....,))))..)))).,{{{((((((((((((((((((((({...}))))))))}...)))),}))).,,,,,..,.......,,.{{.,{{{..,{|||}.,,,}}},......}}}}}}}((((((((((((..........((((.((({{.((,{{,,.....,,,{..(({......)))..,}}},.{(((((..({.{,((((.{((((.,(((((.,,{{(((({((((.(((((..(((((......)))))..))))))))),((((((.(((((..((((.{.....(((((((...)))),,))..,,,,(((((((....))))))){||||{,,,..}}}})),....}.)))).))))).)))))))}}}}}}......,||.........{{.....))......}}.{|||{{..,....,....}|||||.,,}))))}}}})),..)))},)),)),,,))))))}}))))))..))))))))))))))))|||.{{(((..((((((..{{{|....))))}....))))))..})))}..||,,...,,((({{{{...,,,,(({,{{,...,(((((.......))))),|{...,)))}||.....(((((..(((((((.(({{{.(((((........))))).})})}.)))))))..))))).....,||||{{,....,||}}}}(((((((((,.....}))))))))})}}}}}....,,||..........((((((((,,(((((.......)))))..,,...(((((.(((..(((((((......)))))))..))).)))))(((((...,((((((..((......)).)))))).,...))))).....((((..........))))..))))))))...,,,,}))))|,,}.,,}),))),)))},..............|||||.....,,,)))}}.))))))...))))).))}..|{|||{.,....}.)))))}||,...})...))))))).}..))))||.......}..,...))))))).})},||}}}..,,......})))}.))..))))))))))..(((((,.....))))).....,,,,{{,,....{{(({{{,,...||||}||||,|}...,,..{{{{{,..{{((((((.,..{(((((((((((.(((((,{,((....|}.}.})})),|,((((....)))}....{{{(({{{{||,,|,|,.,,.}}}}|,,||||,,..{(((......)))}}},,.||||||.,}})}}}}{{{((((((((((((((((((((((((((......,..{(((({,{,|||||{{{{||..{(((((...(((((((....((((...,,..........,|....)))).....))))))),)))))}.||.}}}}((((((....)))))){((((((.(.(((.(.((((((((...,{{{,,{{{{{{,....((((..((((((...........))))))..))))(((((((((,{..,{{{{..,,,,,.}}}}|,,,,|||,|..{(((((..(({.((((((((((....)))))...{{{{.(((((({{(((,{,.,,,.,,,}))}{{|{....,}}},,,||}}||.}}}}))))))),.(((((..,.{{((((((..,.((((,.....}}}}.,,,,..)))))}.}),..))))).))))).})).))))))||||||||{({.({,,{{.,..,})..((((((....(((((.(((((...))))),,,{({{.....})}..,,,,.((((((((.((...((((.(((((.(((((((((((((.............,.,({.{({(((({..((((..,({.........}},.,.))))..))))).))},}.((((((..(((({...}))))..))))))...)))))))))))))...)))))))))...)).))))))))))))).....)))))).,,{{,|....||,...((((((.((((........)))).))))))...}}})).)))))))).))}..,.))))))))),.(((((((...(((.....))))))))))...}}})))),.))))))))))))).))))))}..{{{...,,,)))(((...)))...(((((((.((((((((((..((((((((.(((((((.((((((....(((((...,,,..........,,,...)))))....))))))..))))))).))))))))...)))))))))))))))))........((((((...(((((((((......))))))))).((((((..........)))))))))))}.,|{{{|,(({(.((({,,,}}}}.}))).,|||||,..}}}|||{{......{{{|||.,,,.}}}}},{((((((..(((((((((((.((((.(((.((((((.(({.(((....((((,{.....))))....))).))).})..)))).)))..)))).))))))))))).))))))),.....,,}))),)))))})}|((((.....))))|(((..,{(({.{((((((((((...)))))))))}.,..,})}}}}})))},,,.,{{(({{({{..,,,,{{|||,,|||{((((,......||||{.....}})))))))}},,|}||||,.,||||,||||||||}|{|{{{{,|,|||..{{{{,{{{(,,,,.....,,}|||.|}}}..,|||,.||}|||||.....})))},}},,}}},.{{{{{{{{........))))))))..,)))))))))))))))},.....,))})))))))))))))))))))}..|{|||,,.......}}})},,,|{{((((((.....))))))).}}}...(((((((((.........)))))))))}}}}}}})....||.(((((((((...........)))))))))))......,,,..}}}...))))))))))))..,..))))))))))))),....}})}},,,,,,,..,||,|,...,|,.,|||..,...,,..........)))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320445.2 NCBI
ACAGUCGUUCCGCCACCUCCCAGUCGGGUUGCGGCGGAGGCCGUUCCUG… 4151 nt 0.3708
NM_001320446.2 NCBI
ACAGUCGUUCCGCCACCUCCCAGUCGGGUUGCGGCGGAGGCCGUUCCUG… 4310 nt 0.3742
NM_015358.3 NCBI
ACAGUCGUUCCGCCACCUCCCAGUCGGGUUGCGGCGGAGGCCGUUCCUG… 4224 nt 0.3712
Summary

This gene encodes a protein that localizes to the nuclear matrix and forms nuclear bodies via an ATP-dependent mechanism. The protein is predicted to have coiled-coil and zinc finger domains and has RNA binding activity. Alternative splicing produces multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.