Basic Information

Symbol
MPHOSPH9
RNA class
mRNA
Alias
M-Phase Phosphoprotein 9 MPP9 MPP-9
Location (GRCh38)
12:123152320-123244014
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022782.4
Sequence length
6369.0 nt
GC content
0.3972

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1646.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1766.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1513.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((.((((..(((.(((((((((((.((....(((((.(....)))).))..)))))))))....)))).)))..(((((((((........))))))))))))).))((((..((((((..((((((((((((.....((((((((.....((((((.....((((..(((((((((.((..(((((((......)))))))..(((.....)))...((((((((((.......(((((((.....)))).))).......))))))))))..(((((((.........((((((((...((((.....((((((((.((.(((.(.(..(((((............)))))..)).))).)).....(((((((.(((((.(((.(((((((((((((.(.(((((....)))))....(((((((((((((......))))...((((..((((((((((((((...(((((....((.(.(((...((((((((...(((((((.........)))))))....)))))))).))).).)).)))))))))..................((((((((...........((((((........))))))..............))))))))(((((....)))))........))))...)))))).)))).(((((((((((((((((........)))))))).)))))))))..........(((......)))..(((((.....((((((((.(((((((((..((.......))..)))))))))((.(((((((............(((((((.((((((...((((......))))))))))((((..(((((...)).)))..))))(((((((..(((((.....))))).))))).))......)))))))))))))).))(((((((.(((((((((((((.((((((((.....(((....)))...((((((((((((((((..((((.((.((((((.(((((((((.....(((((((...((((((.....))))))...))))..))).....))).))))))....(((((...)))))..((((.(((..((.......(((((.(((((..(((......((....))......))).))))).........((.((((..((((((.((((((((((...(......)...)))..)))))))..)))).))..)))).)))))))........))...)))))))..........(((((((.(((((.(.((.((..(.(((((((((.(((((......(((((....((((((.((...(((((..((((....)))).))))).)).))))))....))))).((((.(((...(((......(((...(((((((((((.((.((((((...((...(((.((((((((...............(((.....((((((.....(((((....)))))...))))))....))).............((((((((((((..(((....(((((((...((..((....))..))....((((((((((................)))).))).))).((((((...(((........))).))))))((((...))))...((((((((.....))).)))))................)))))))....))).)))))...)))))))..)))))))).)))...))...)))))))).((((((..(.(((((...((..((.(((......))).))..))....))))).)..)))))).........)))))))))))..))).....)))..)))))))..((((((......)).))))(((((...)))))))))).)))))))))...(((((((((...........(.((.((((.(((.((((.((.(((((.((((....((((..(((.(((((((....))))))).)))...))))......((((........))))....((((((((..((((.........))))..)))))))).......(((((((...((((((...(((((((((..((((((.......))))))....(((((..(((((..((......((((....(((((((.((.(((((((.(((((((((....))).......((((.....))))((((..(((((((((...............)))))))))....)))).((((((((..(((((((((((....((.((..((.(((((..............................)))))...))..))))....)))))))))))....)))))))).......(((((...(((((((((.(((...(((((........................)))))...))).)))..)))))).))))).(((((........)).))).(((((....(((((((((...(((.((....))..))).))))))))).))))).(((((.(((((((((((((((((((((...((((((...))))))...........((((((....))))))...(((((((((...((((......((((((((...)))))))).......................((((((((((.....(((.((((((((((((.(((((..(((((..((((((.((......(((....))))).)))))).)))))......((((.(((...))).))))((((((..........))))))......))))).)))))))))..))))))....))))))))))............((((..((((((........)).))))..))))...))))..)))))))))................((((((((...(((.......(((((...............))))).(((((((((....))))))..)))..))))))))))).....(((.(((.((..(((.(......).)))..)).)))..))).))))))))..)))).......))))))))).))))).((((((((........).)))....)))).......)))))))))))))...)).))))))).....)))).....)))))))..))))).........((((((..((....)).))))))..(((......)))......(((((((((((.(((((((.......))))))).)))...........))))))))...))))))))))))))))))))))....(((((((...........))))))).....(((((.((((...)))).(((..((....))..)))..)))))))))..))))).))))))))))))).)).)...))))))))).........((((((((...((((...(((......((((.(((((.(((.....))).)))))..)))).....)))....))))....))))))))..........(((((((.........)))))))...)..)).)).).)))))...)))))))))))))..)))))).)))))).((((.(((..(((((..((((...(((((....)))))..)))))))))..)))))))......((((((....))))))))))))))))..))))))))))).)))).)))))))))))))(((((.(((((.(((.((((((......(((((((....))))).)).....((((((....(((((.((((..((((..........((((((((..........))))))))............)))).))))...)).)))....))))))....)))))).))).))))).))))).))))))))....)))))...)))))))))....(((((((((((((......)))))))))))))((((((....(((((((...((((((((....((((((.((((((((((..(((((....)))))....)))).)))))).....................))))))..))))))))....)))))))......................(((((....))))).......)))))).((((....)))).................).))))))))))))).))).)).)))..)))))))....................)))))))).....)))).)))))))))))))))...........))..))))))...))))))).......)))))).....))))))))......)))))))))))).((((((.((((.(((((.......)))))..)))).))))))....................((((((((((....)))))))))).(((..((((.((((((((((((((((.........(((((......)))))....((((((((..................((((((.((((((....)))(((((((((((......))))))))))))))..))))))...)))))))).........((((((((((....(((((((.((((...((((((((((.......(((((...)))))....)))).).)).)))((((....((..(((((.......)))))..))...))))..)))).)))).)))))))))))))(((((.((((.((...((.(((....((((.((((....)))).))))..))).)).)).))))))))))))))....))).))))))))))))..))).((..((((((((((((.(((.((..(((((.((((((((((((((....(((((((.((....)).)))))))...))))))........))))).))).)))))..)).)))..(..((((((.....((.((...(((((...........)))))))))....))))))..).(((((((......(((((......(((((..............))))).............((((((((((((......(((((((((((.(((.(((((((((((((.....))))))((((((((.(((((((((...))).))))))(((.....))).((((........)))).))))))))((((((((...(((((((....................)))).))).....))))...)))).....(((((....((.((.(((((.((((..........))))..))))).)).))....)))))....(((((......)))))((((..((((..(((..((((((((.((((((((.((((.((....)))).)).))))..))))))))...)))).)))))))..))))......)))))))))))))))))))))...((((((.((((((((((............)))).))).))).))))))....(((((((......)))))))...(((((((((((((((((((((((((...))))))...((((((((.(((.....((............)).....))).))).)))))......((.((((((......(((....)))......))))))))............))))))....((((....))))..))))))))))))).....((((....))))....))))))))))))((((((.......)))))).....)))))...))))))).........))))))))))))..)).........(((((.........)))))((..((((((((.(((((((.......)))........((((((.((.((((.(((....((((((((((((.((((.(((((((((..........))))))))).))))...((((......))))...........((((((.......................))))))...((..(((....)))..))..))))))))).)))...((((((.....))))))..))).)))).)).))))))........(((((((....)))))))))))...))))))))..))....(((((((((((((((.(((..((....((...(((....)))...)).....))....)))...)))..))))))))))))..........(((((......((((((((...(((.......)))....))))))))....))))).))))))..))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,{,({(({{{{{((,,{{{,|||||{||||.,,,{{{{{.,...{||}|.||{{|,|||||||{{.{{{,,.{{{..(((((((((........))))))))),,,,.)){(((..,,,,,|}}{(((((((((((.....((((((((.....((((((.,{,.((((..{((((((((.((.,(((({{{......}||||},...,,..,,,),}...((((((((((,,,,,..,,((({,..,,,,}}}.)}),,}....))))))))))..(((((((.........((((((((...((((.....((((((((,((.{((,(.,..(((((............)))))..,,,})),},}}},.(((((((.(((((.(((.{((((((((((((.{.(((((....))))),,....{{,.,.||{{{....,,||||{{{(((({{,,.{({,.{{(((,..,(((((....((.(.(((...((((((((...(((((((.........}))))))....)))))))).))).).)).)))))),,....}},,,,,,...(((((((((((,...........{(((((........)))))}....,,(,,,,.|||{(((({{{{|||,...,}}}},(((((,.,((((((((.{(((({,..(((((((((((((((((........)))))))).)))))))))...,,.....{{{.,,,,{|,|...{((,.....{((({....(((((((((..((.......))..))))))))).}))))}}}..,,},|||}}}((((((....(((((((((((((((.(((...(((((((((((((({(,...)).{{{{..(({(((,.....})))))....}}|||,{..||.(((((...))))).,}},,.}}}..(((((((.(((((({((((((.((((((((.....(((....)))...(((((((((({(((((,.,(({.(({((((((.,(((((((({{{,.,,{({((,,.(((({(,,,.,||||||.,{||||{,{|,{{,..|||,||||,.....{{{{{..,|||}}.......|{|||,,.....,{({{{{{{{{((,.{{{..,,,,((,{,,||.,,,,,|||,||||,..,,}}}..{{.((((..((((((.((((((({({...,......,...)))..)))))))..)))).))..)))).))}||||||.{{{{{{{...{(((,|{....(((,....{|||||{,,,,,}}))))}....|||,|{,{,||||||..}}}.|}|||}|||((((((.{{..,(({((,,((({....)))).|||||,|}.}}}}}}..}}))))),|||,,|}}}|.......,..|||,..{{{{{||{{{|.{{,{{{{{{...((,..(((,((((((((...............(((.....((((((.....(((((....)))))...))))))....))).............(((((({((({{..{((,,,,,{{{{{{...{{..((....)).,}},,.,|||||||||{..,,}},.||,,,,..},}}}})),)})}|||,|{,,,|||,,.,,,..}}}.}}}}}}||||||.}}}},,.{{|{||||...,,))).))))),.,,,,,,,,,,}.,,))}))))....}}}.}}}},..,||}},,}..,}}})))).}}}...,,...}}|||}||{((,(((,,(,(((((...{{..{{.|||,,....|||.}}.,||....})))).},,))))},.,.......}}}))))}})}.,},|((((((({....)))).))))}.......{{{{{|..|||||||,,,{(((,({(((.(((.(((((((((((..(((...}}}....(((((..((.{(((.{{{{.....((((..,,))}}.((((..(((.(((((((....))))))).)))...))))...)))|.||.)))))...,,.....((((((((..((((.........))))..))))))))...)))))))).)))...(({....,||((((((,..((((((.......)))))).}|}|||,{..|||,|}}|,}}}}.....{.{{(((((((,...}}|||,||}|{{{,,(((,{..,,|{{,....}}}}.....}}}}|{,|..(((((((((..,........,...)))))))))}}}}))))})}}|((((..(((((((((((....({.{{,..(,(((((..............................)))))}..},.,,.))....))))))))))).)}}),}}(((((((((.{,.......,.))))))))}........((((..(((({,..,{{(({(,...}))))}....}}))))))..))))..}}}}}|,|||}}.,}}..},})))}|||,...}}|||||||,,....,,.{{,,......|||{}}},,)))|.,}||}.(((((.(((((((((((((((((((((...{(((({...,}}})).......,,..((((({....})))))...(((((((((...((((......((((((((...))))))))...........,....,,.....((((((((((.....{((.{{{(((((((((.(((((..(((({..((((((.,,.....{(((....))))).)))))).)))))...{{.{(((,(((...}}},|}||(,,{||,,,.,,,..})}))))....,,))))).)))))))))..)))}}}....))))))))))......,.....((((.,((((((........)).)))).,))))...))))..)))))))))...............,((((((((...(((.......(((((...............))))).(((((((((....))))))..)))..))))))))))),....(((.(((.{(..(((.(......).)))..)).)))..))).))))))))..)))),......,)))))))).))))).{{{,((({........).)))..,,}}},.......}}|||||||}}}},}}}}}},})))}.}}}..)))}},....|||||{{|||||...{{.{{{(((((({{{,....,}.,,||,|{{{...{{{{{{{|......(((((((((((.(((((((.......))))))).))),..........})))))))...,,,||||||((((((((((((..((.(((((((..,.....,..)))))))...{.(((((.((((...)))}.(((..((....))..)))..)))))}))..))))).))))))),}.||||{.....|||{||(((||..,,..,{{((.(((.({.{(.....}})}.})).}}}||.,{{{,}|||.,,}|}}}.|}}|{{{|,,.......}|,,,|}))}..,,),,))))..,}}},.,..{{{{|||.,,....,.))))))}...,}},}}))))))))).||.}}}}))}))))),}},.))))}),))))}{(((.(((..(((((..((((...(((((....)))))..)))))))))..))))))}......((((((....))))))))))))))))..))))))))))).}))).))))))))))))).))))),}))))))))...))).)))))))))),.((((((.{((((.((((.....))))))))}.)))))).}{((({....,)))|(((((((..........))))))),....)))))...)))))).....,.,..(((((({........)))))))......)))))))))))))))))))..},},))))},)))))))))))..(((((((((((((......))))))))))))).,||,,,,,.(((((((...((((((((....((((({.{(((((((((..(((({....}}})}..,,)))).)))))}..,,......,}.........})))))..))))))))....)))))))...,.}}}}}}}}}........(((((....)))))......,|.||,..|,||...,}}}|..,...........,.,),))))))))))))}.))).)).)))..)))))))......,{,.........,,)))))))).....)))).))))))))))))))).....,}}},.))..))))))...))))))).}}....)))))).....))))))))......)))))))))))}.{(((((,((({.(((((.......)))))..)))).))))))......,{{{{{{{{{{{.{((((((((((....)))))))))|{(((..,,,|}||||||||||||,,,...}}}}}|.(((((......)))))....((((((((.........,,,......{(((((.((((((....)))(((((((((((......))))))))))))))..)))))),,,))))))))......,,.((((((((((....(((((((.((((...({{(({({{{,......(((({...}))))...}}})),}.}}.}}}((((....((..(((((.......)))))..))...)))}..)))).)))).)))))))))))))|||,|}||||}||}}}},.,|}}}..|{(({(((({{{.(((((((((..{{|,{|.{(((...))))})))}},}..))).)))))),))))),.}}),||,,((((((((((((.(((.((..(((((.((((((((((((((....(((((((.({....)).)))))))...))))))........))))).))).)))))..)).))}.{({,(.((((....}}}}{{...(((((...........))))),,}},},.,}},||{{{{(({,,({,,,...{|||||,,|,,||||,............,,|||||{{{....,}}}.,|{{(((({{{(({{{{..(((((((((({{((,{(((((((((((((.....))))))((((((((.,{{((((((.,,||,,,}}}))||{.....))),((((........)))).))))))))((((((((...(((((((....................))))},)).,,..)))}..,)))).,,..{((({.....{.((.,((((.((((..........)))).,))},).,..,}....}}}}}..,,{{{{{......)))))((((..((((..(((..((((((((.((((((((.((((.((....)))).)).))))..))))))))...)))).)))))))..))))......)))))))))))))))))))))..,((((((.((({(((((((..,,.......,)))))}),))).)))))}.,|,|{{{({{{,....})))))},,,{,{{,,,,,,,.||,||||((((((...))))))...((((((((.(((.,,,.,,...,,....,..))},...))).))),,))))......((.((((((......(((....)))......))))))))....,})),..,}}}}}},,,,{{(({{|||}},..}))))}},,,,,..|{|{(((({|,,,,||,...,}))}}}}},,,((((((.......))))))..,})))))}}}}))))))),,.......))))))))))))..}}.........(((((.........)))))((..((((((((.(((((,,.......|||........((((((.((.((((.(({....((((((((((((.((((.(((((({{{.,{{,....}))))))))).)))),{,((((......)))).,}........((((((.......................))))))...{(..(((....)))..))..))))))))).)))...((((({.....})))))..})).)))).)}.))))))........{((((((....)))))))))))...))))))))..))....(((((((((((({((,(((..{{.,,.({...{||....}}}.,,))...........,}}...}))..))))))))))))..........(((((......((((((((...(((.......)))....))))))))....))))).))},,,..,,,,........................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022782.4 NCBI
CCCUCGGGUAACGGUCGCGAGAGGCCGCUUGCAUGACCCUGACAUCGGC… 6369 nt 0.3972
Summary

Involved in negative regulation of cilium assembly. Located in Golgi apparatus; centriole; and centrosome. Implicated in multiple sclerosis. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that M-phase phosphoprotein 9 (Mphosph9) was down-regulated specifically in liver tissue following neutron exposure, as identified through oligonucleotide microarray analysis of 6,050 genes [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].