Basic Information

Symbol
MPLKIP
RNA class
mRNA
Alias
M-Phase Specific PLK1 Interacting Protein C7orf11 ORF20 TTDN1 M-Phase-Specific PLK1-Interacting Protein TTD Non-Photosensitive 1 Protein Chromosome 7 Open Reading Frame 11 Russell-Silver Syndrome Region Non-Photosensitive 1 Tricothiodystrophy ABHS TTD4
Location (GRCh38)
7:40126027-40134622
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138701.4
Sequence length
7627.0 nt
GC content
0.4112

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2765.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138701.4 NCBI
GAUACAGUUCCGGUGGGAGAACGCGGCUGCGAGGUUUUCGGCUUUGGCU… 7627 nt 0.4112
Summary

The protein encoded by this gene localizes to the centrosome during mitosis and to the midbody during cytokinesis. The protein is phosphorylated by cyclin-dependent kinase 1 during mitosis and subsequently interacts with polo-like kinase 1. The protein is thought to function in regulating mitosis and cytokinesis. Mutations in this gene result in nonphotosensitive trichothiodystrophy. [provided by RefSeq, Nov 2009]

Forensic Context

A study in humans identified the MPLKIP as a single-gene blood biomarker, where a machine-learning classifier using 25 genes, which included this marker, differentiated healthy controls from methamphetamine-dependent subjects with 87% accuracy, and a classifier using 20 genes further differentiated methamphetamine dependents from those with methamphetamine-associated psychosis with 95% accuracy [Breen et al. DOI:10.1038/tp.2016.67].