Basic Information

Symbol
MRAP
RNA class
mRNA
Alias
Melanocortin 2 Receptor Accessory Protein FALP B27 C21orf61 MRAP1 Fat Cell-Specific Low Molecular Weight Protein Melanocortin-2 Receptor Accessory Protein Fat Tissue-Specific Low MW Protein Chromosome 21 Open Reading Frame 61 GCCD2 FGD2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001379228.1
Sequence length
930.0 nt
GC content
0.5645

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-328.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -343.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((....((((..((((......(.((.(((((((..((((...(((((.(((((((.(((...))).)))).))))))))))).)..))))))))).)((((......))))....((((.....((((((((....((((.((((((((.......((.((..((((((((......((.((((((.........(((...)))..........)))).)).))......))))))))..)).))((((....(((((((((((.((((((((((.((.........................)))))))))))).)))....)))))))).........(((((..(.((((((.........(((.((((....)))).)))...)))))))..)))))...(((((((...(.(((.(((((....)))))..)))).))))))).))))..((((......))))..(((((((..((((.((((((....(((((.(((((((((((((((((...............))))))))).(((((((...))))))).)))))..))).)))))...)).)))))))).((((....))))..(((((....).))))(((....)))....)))))))))))))))))))...((((........))))....((((......))))((((........((.(((((((.(((.........(((((((..((((....((((..((.....))..))))))))))))))).........)))))))))).)))))).))))))))..))))((((((.(((.(......).)))))))))..(((((((.(((...((........))...)))..))))))).............))))))))..))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........,{{{...,,({,{(({,,....,{.((.(((((((..{(((...((((,,(((((((.(((...))).)))).))))))))))).)..))))))))).}((({......)))),...((((.....((((((((....{(((.((((((((.......{(,((.,{{{{{(({...,..{{,,{{||{..,|..,.,(({...}||,.........}|||.,},}}...,.,}})))))}.,}}.))||{{,,,.(((((((((((.((((((((({,((.......,....,,....,......)))))))))))).)))....)))))))).........(((((..(.((((((.........(((.((((....)))).)))...)))))))..)))))...(((((((...{.(((.(((((....)))))..)))).))))))).}}}}..{{((,.....)))),.(((((((..((((.((((((....(((((.(((((((((((((((((...............))))))))}.(((((((...)))))))})))))..))).)))))...)).)))))))).((((....))))..{((({....}.)))|(((....))),...))))))))))))))))))}...((((........)))},{..((({,,....)))))..}},,..,..{(.((((({{{(((.........(((((((..((((....((((..((.....))..))))))))))))))).........)))))))))).)).)}).))))))))..))))(((((,,(((.(,....,).)))))))))..((({(((.{{{..,((.,,,,,,,||,,.,,,..)))))))........,,,,,,))),,,),,}))},...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGAUAAUGGGGAGGCUAUGCAGGUGUGUGGGCUGGAGGGACUUUGCAGA… 884 nt 0.5351
ACAGACACACUUGGACGAUUCCUGCAGAAAUCAGUGAGGCAGUCUCCUC… 930 nt 0.5645
GGAUAAUGGGGAGGCUAUGCAGGUGUGUGGGCUGGAGGGACUUUGCAGA… 1000 nt 0.5350
GGAUAAUGGGGAGGCUAUGCAGGUGUGUGGGCUGGAGGGACUUUGCAGA… 627 nt 0.5056
Summary

This gene encodes a melanocortin receptor-interacting protein. The encoded protein regulates trafficking and function of the melanocortin 2 receptor in the adrenal gland. The encoded protein can also modulate signaling of other melanocortin receptors. Mutations in this gene have been associated with familial glucocorticoid deficiency type 2. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Dec 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MRAP gene was downregulated during long-term (0 to 12 months) weight loss in subcutaneous adipose tissue of weight losers [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].