Basic Information

Symbol
MRAP2
RNA class
mRNA
Alias
Melanocortin 2 Receptor Accessory Protein 2 BA51G5.2 C6orf117 Melanocortin-2 Receptor Accessory Protein 2 MC2R Accessory Protein 2 Chromosome 6 Open Reading Frame 117
Location (GRCh38)
6:84033203-84090887
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138409.4
Sequence length
2137.0 nt
GC content
0.4553

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-663.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -707.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 579.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001346541.2 NCBI
ACUCGCCCGGCCCUGGGCGGUGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCUCGC… 2037 nt 0.4561
NM_001346542.2 NCBI
ACUCGCCCGGCCCUGGGCGGUGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCUCGC… 2381 nt 0.4578
NM_001346543.2 NCBI
ACUCGCCCGGCCCUGGGCGGUGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCUCGC… 2231 nt 0.4572
NM_001346544.2 NCBI
GCGUGUGGACGCCGCUGGGCGUCCGAAAAGCCUGGAAGCGGCGGCGCUC… 2139 nt 0.4511
NM_138409.4 NCBI
ACUCGCCCGGCCCUGGGCGGUGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCUCGC… 2137 nt 0.4553
Summary

This gene encodes a protein that modulates melanocortin receptor signaling. The encoded protein has been shown to interact with all known melanocortin receptors and may regulate both receptor trafficking and activation in response to ligands. Mice lacking a functional copy of this gene exhibit severe obesity and a mutation in this gene may be associated with severe obesity in human patients. [provided by RefSeq, Oct 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that postmortem midbrain analysis of chronic cocaine abusers identified the MRAP2 as a diagnostic transcript and protein robustly expressed in dopamine neurons, showing a 1.5-fold downregulation in abusers [Bannon et al. DOI:10.1038/Npp.2014.70].