Basic Information

Symbol
MREG
RNA class
mRNA
Alias
Melanoregulin DSU WDT2 Dilute Suppressor Protein Homolog FLJ10116 Whn-Dependent Transcript 2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_018000.3
Sequence length
3148.0 nt
GC content
0.4450

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1261.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1315.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 848.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...................(((.(((.((((((((((((((((..(((((((((((((((((((........))))).)))).((((((((......))))).)))..))))))).((.((((........)))))).(((((((...)))))))(((((((((..(((((((.((((((.(((((((((((((....(((.((....)).)))...))).....))))))))))(.(((((.......))).)).))))))).))))))))))).)).)))))).))))))))).)))((..(((....)))..)).(((.(((((((...(((((((((((.((((...)))))))))))))))((((((.....((((((........)))))).((.((((.(((((..((((......((((....)))).....(((.((((((..((.((((((((((..(((((...(((((((.((((((.((((((....(((.((((((((((.((..((((((..(((((.....(((((.((.((.((((((((((.((((((....))))))....((..((((((........))))))..))....((.(((.((((((((..........(((((....(((((..((..(((((..((((.(((.........)))...))))..)))))..))..)))))..(((((((....)))))))))))).............))).))))).))).)).((((((....((....))....))))))((((((.......)))))).......(((((.....))))).))))..)))))).)).)).)))))....)))))........(((((((.(((((.((((((....))))))...(((.((((....((((((((((((....((((((((((((...(((((((((((...)))))))).............)))...)))))))....))))).(((((((...)))))))(((((..((.....)).)))))......((((...((....(((((.....(((((........))))).....)))))...))....))))((((((((..(((......))).))))))))..))))))))))))...)))).)))....(((((((((((.........((((((((........))))))))..........))))))...)))))...))))).)))))))(((...)))...((((((.(((......(((.((((.....)))).)))........))).))).)))(((((((((((..........))))))))))).)))))))).)))))))..))).)))...))))))....((((.(((..(((((...(((((((((.......(((((((.((.(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((((((((((.((.((((((.(.((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((...((((((((((((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((..(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((......(((((((((((((((((((((((((((...(((((...((((((...................))))))....))))).(((......((....))........))).....................))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))).)))))))))))).))))))))))))))))).))))))))...))))))))))))))).))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)).).)))))).)).))))))))))))).)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))).))))))))).......)))))))))..)))))..))))))).))))))..)))))))..)))))..))))...)))))))).)))))).)))))))..))))))))).)).))))))..(((..((((((((.(((((((.....((((((((((((((((((((((..((((((....)))))).............(((((((.(((((....))))))))))))((((........)))).))))))).....((((..(((((.......)))))..))))....))))))).........((((((((((((.((((((((((((...((((((.(((........(((..((((((((((....)))))))))).))).....(((...((((((.(((((((.....))))))).))))))..))).....)))...))))))..))))))))).........)))))))))))))))(((.(((((((((((..........(.(((.....))).)..........)))).))))))).))).........((((......((((((.....))))).).......))))...((((((......))))))..))))))))....))))))).....((((........))))(((((((..............)))))))......((((((((...((((..((((((((((((((.(((...................))).)).))))))))))....))....))))...))))))))........(((.(((((......))))).)))..)))))))))))....))))))).))).(((((((.((((((..(((.(((((....))))).))).))))))))))))).((((....)))).......(((((....)))))........))))))).)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,,,.{{,,,,........,,..((((((((((((((((,,({{{(((({((((((((((,{...,{{|||||,||||,((((((((......))))).))).,||||||}|||,||({{{{{.{{.||}}||.||{||||.}|)|)))},,|||||,||,,|||,|||}}}))),,{{{(({{{{,{||,,||||{,||,||||||||},,,})))})),))))))))))}|,|||||||||..{{{{{{{{.,||||.|||||,||}}},||||}.}}),))))))))),)|(((..(((....)))..))}|,{.{,,,.,{|{{(((((((((({,((((...))))))))))))))}|||,||...,,((((((,{,.,{{.,|||||.({((({{.{{(((..((((.,...,((((....))))......{(.{(((((..{(.{{{{((({((,.{{{((...{((((((.{((({{.{{((({..,.(({.{{{{{{((((.{{,.{{{{{{..(((((.....(((((.((.((.((((((((((.((((((....))))))...,({..((((((........))))))..)}....{(,(((.((((((((...,......{{{{{,{{.,{{{{{{(({.{((({..,,{|,(((.{.......)))...,,||{{|||,,..})}}))}}}|}|{(((({...,))))))}}}}}},...,..,,,,,,}}}.})})).))},},.{((({{....,|,..,}}..,.}}}}},((((((.{....})))))).......(((((.....))))).))))..)))))).)).)).)))))....)))))...,,,,,((({{((,(((((,((({((,,,,|}}|||,,,({(,((((,,,,{{((({{{{{||.,,.{{,,((((((((...(((((((((((...)))))))),............}))...)))))))}...}}}||,((((((,...,||||}}{{,{({({({{,,,|((|({||({{{.....{,,|||{,,,{((({.....,{{((,..,...,}}|||.{,..|||||{,{|,,|||||||,{{{|||,,,,||}},,.,||}|||||,}}|,,}}}))}}}}}}|,,.}}}}.|}}....(((((((((((......,,.((((((((........)))))))).,,.......))))))...}))))...}))}).}}}}|||({....,)),,|(({{((,{{{.......,{,|,||.....||||.|..........,,,.}}}.)))|{(((((((((..........))))))))),}.)))))}}).}))))))..))),})),,,||||||{{{{,,,.}}||.,|||||,..(((((((((.{,....((((((((((.(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((((((((((.((.((((((.,.((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.,.((((((((((({{(((((((((((((.((((((((((((.(((((..(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((......(((((((((((((((((((((((((((...((({(,{,((((((...,,........,,....)))))).,,.))))}.{((,.....,,....||........,,,.............,,......))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))..))))).)))))))))))).))))))))))))))))).))))))))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)).}.)))))).)).))))))))))))).)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))).)))))))))..,,...)))))))))..)))}}.,))))))),}))))),.))))))),,)))}}..}}})},.))))}})),))))},,))))))).,)))))}})))})}))}}}}||||,|{((({||{..||{{{{{,,..,({({(({{((((((((((((((..((((((....}))))}............{(((((((.(((((....))))))))))))|(((........)))).))))))).....((((..(((((.......)))))..))))....))))))).,{,,,,,,{{{{{{{{{{||,|{{|{,((((({,,.{{{{{|||||...|}}},|||||((((((((((....}))))))))).|||{{{..(((,..((((((.(((((((.....))))))).))))))..||||||,.||||||}}|,}}||}}}}}}}}}..,,||,,.}}}}}}}))))))}}(((.(((((((,{,,,,,,......{.({(,,,..}}}.,,,,,....,,)}},.))))))).)))........,{{{{,|,,,.|{((({.....})))),),,,.,)})))).|,{{{{{{......}}}},}..}}})))))..},)))}}}),},}}|{,{,,,.....,||,(((((((..............))))))).}|...,,,|||{,...,,,,....((((((((((((.{{{...................})).}).))))))))))...,}},,,})))),}.})})}))),,}},,)}|||,|||{{,,,,..|||||||}}..,}}}}})}))))),,}})|}},.})),{{{{{{{{((((((.|{{{.(((((....))))).}}).))))))))))))).|(({....)))|{({,...|||||{{{.||||.,,....,,,))))))}....,,,}},.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AAAACUCACGCCCCAAACAAAACGCAAGGAGAGGAGGGCGCGCGGCCUG… 3298 nt 0.4509
UUCAACUUGAGCUUUAGUUUCUUCCUUUGGUAUUUCUUCUGCACUCCUU… 2964 nt 0.4092
AGUCUAGUGAGAGGCAGUCCUGCGUUCUGCCUGGUGGGAGUCAGAGUCU… 2951 nt 0.4155
AAAACUCACGCCCCAAACAAAACGCAAGGAGAGGAGGGCGCGCGGCCUG… 3148 nt 0.4450
Summary

Predicted to enable phosphatidylinositol binding activity. Predicted to be involved in melanocyte differentiation; melanosome transport; and phagosome maturation. Predicted to act upstream of or within developmental pigmentation. Predicted to be located in late endosome membrane and melanosome membrane. Predicted to be part of protein-containing complex. Predicted to be active in melanosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MREG is differentially expressed at baseline between alcohol use disorder (AUD) and control lymphoblastoid cell lines and is affected by ethanol exposure [Ferguson et al. DOI:10.3389/Fnmol.2022.1032362].