Basic Information

Symbol
MRPL18
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial Ribosomal Protein L18 HSPC071 UL18m 39S Ribosomal Protein L18, Mitochondrial Large Ribosomal Subunit Protein UL18m MRP-L18 L18mt Mitochondrial Large Ribosomal Subunit Protein UL18m
Location (GRCh38)
6:159789812-159799027
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014161.5
Sequence length
970.0 nt
GC content
0.4804

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-307.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -324.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 228.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318817.2 NCBI
GAGAGUUUGGGGAUCUACAGCAGCCAAAGGCUUGUCCCUGACUUUAUAU… 821 nt 0.4750
NM_014161.5 NCBI
GAGAGUUUGGGGAUCUACAGCAGCCAAAGGCUUGUCCCUGACUUUAUAU… 970 nt 0.4804
Summary

This nuclear gene encodes a protein component of the larger 39S subunit of mitochondrial ribosome. This protein may also aid in the import of nuclear-encoded 5S rRNA into mitochondria. Alternative splicing results in multiple transcript variants, most of which are not predicted to encode a protein. A pseudogene of this gene is found on chromosome 16. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MRPL18 was overexpressed in the ventral midbrain of a methamphetamine high drinking line compared to a low drinking line, identifying it as an example of a mitochondrial ribosomal protein with differential expression linked to innate risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].