Basic Information

Symbol
MRPS25
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial Ribosomal Protein S25 MRP-S25 RPMS25 MS25 28S Ribosomal Protein S25, Mitochondrial Mitochondrial 28S Ribosomal Protein S25 Small Ribosomal Subunit Protein MS25 DKFZp313H0817 FLJ00023 S25mt Mitochondrial Small Ribosomal Subunit Protein MS25 COXPD50
Location (GRCh38)
3:15009611-15065339
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022497.5
Sequence length
4572.0 nt
GC content
0.4709

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1541.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1622.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1129.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022497.5 NCBI
GCGGGAAGUGGAACCUGGCUCUGGGGAGAAGCCGCGUGAGAUCCGCGCG… 4572 nt 0.4709
Summary

Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 28S subunit protein. A pseudogene corresponding to this gene is found on chromosome 4. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the MRPS25 as a top sustained decreasing gene (SDG) with expression declining from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury), classifying it as a core biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].