Basic Information

Symbol
MRTFB
RNA class
mRNA
Alias
Myocardin Related Transcription Factor B MRTF-B MKL2 Myocardin-Related Transcription Factor B MKL And Myocardin Family Member 2 MKL/Myocardin-Like Protein 2 Megakaryoblastic Leukemia 2 MKL1/Myocardin Like 2 MKL/Myocardin Like 2 FLJ31823 CTA-276F8.1 KIAA1243 NPD001
Location (GRCh38)
16:14071058-14266778
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001308142.2
Sequence length
8804.0 nt
GC content
0.4418

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2485.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2652.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2137.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308142.2 NCBI
GAGAUCGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGGGAGGU… 8804 nt 0.4418
NM_001365411.2 NCBI
GAGAGAGUUAAGGGCUUCCAGCGGCAUGAGUGUAUUUGCAGGUCAAGCU… 8825 nt 0.4410
NM_001365412.2 NCBI
GAGAUCGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGGGAGGU… 8828 nt 0.4376
NM_001365413.2 NCBI
GAGAGAGUUAAGGGCUUCCAGCGGCAUGAGUGUAUUUGCAGGUCAAGCU… 8536 nt 0.4393
NM_001365414.2 NCBI
GAGAGAGUUAAGGGCUUCCAGCGGCAUGAGUGUAUUUGCAGGUCAAGCU… 8386 nt 0.4363
NM_001365415.2 NCBI
GAGAGAGUUAAGGGCUUCCAGCGGCAUGAGUGUAUUUGCAGGUCAAGCU… 2216 nt 0.4648
NM_001365416.2 NCBI
GAGAGAGUUAAGGGCUUCCAGCGGCAUGAGUGUAUUUGCAGGUCAAGCU… 1927 nt 0.4608
NM_001365417.3 NCBI
GAGAUCGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGGGAGGU… 4343 nt 0.3615
NM_014048.4 NCBI
UCUCGCGAGAUCGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCCGG… 8684 nt 0.4382
Summary

Enables transcription coactivator activity. Involved in positive regulation of miRNA transcription; positive regulation of striated muscle tissue development; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in several cellular components, including glutamatergic synapse; postsynapse; and presynapse. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MRTFB transcript, a muscular tissue development co-activator, increased in abundance at 1 hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].