Basic Information

Symbol
MSI2
RNA class
mRNA
Alias
Musashi RNA Binding Protein 2 RNA-Binding Protein Musashi Homolog 2 Musashi-2 Musashi Homolog 2 (Drosophila) Musashi Homolog 2 MSI2H
Location (GRCh38)
17:57255851-57684689
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138962.4
Sequence length
6379.0 nt
GC content
0.4162

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1833.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1957.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1836.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001322250.2 NCBI
AGAGCCAGAGAGAACUUCCAGCGCAAAAGGAAAAUAAAACUUGUGGCUG… 6282 nt 0.4077
NM_001322251.2 NCBI
GUGCGAGGCAGCGGGGCUGAGCUAAGCCGAGCCCACGUGUGACGGCUCU… 2340 nt 0.4932
NM_138962.4 NCBI
GUGCGAGGCAGCGGGGCUGAGCUAAGCCGAGCCCACGUGUGACGGCUCU… 6379 nt 0.4162
NM_170721.2 NCBI
CUUUUAGCUUUUGUAAGUUACACGUCAAAAUGGCCGAUCUGACAUCGGU… 2137 nt 0.4595
Summary

This gene encodes an RNA-binding protein that is a member of the Musashi protein family. The encoded protein is transcriptional regulator that targets genes involved in development and cell cycle regulation. Mutations in this gene are associated with poor prognosis in certain types of cancers. This gene has also been shown to be rearranged in certain cancer cells. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Forensic Context

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