Basic Information

Symbol
MSMO1
RNA class
mRNA
Alias
Methylsterol Monooxygenase 1 DESP4 ERG25 SC4MOL C-4 Methylsterol Oxidase Sterol-C4-Methyl Oxidase Sterol-C4-Methyl Oxidase-Like EC 1.14.18.9 MCCPD
Location (GRCh38)
4:165327667-165343180
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006745.5
Sequence length
2227.0 nt
GC content
0.3740

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-564.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -609.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 601.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001017369.3 NCBI
GGCUCCACCCCCAAGCCAGGCGAGGCAGGUUCCGAGGUUGGAACACCUG… 1941 nt 0.3818
NM_006745.5 NCBI
GGCUCCACCCCCAAGCCAGGCGAGGCAGGUUCCGAGGUUGGAACACCUG… 2227 nt 0.3740
Summary

Sterol-C4-mehtyl oxidase-like protein was isolated based on its similarity to the yeast ERG25 protein. It contains a set of putative metal binding motifs with similarity to that seen in a family of membrane desaturases-hydroxylases. The protein is localized to the endoplasmic reticulum membrane and is believed to function in cholesterol biosynthesis. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that alcohol-induced alcoholic liver disease significantly up-regulated the expression of the MSMO1 gene, which was subsequently inhibited by treatment with Gentiana dahurica Fisch ethanol extract [Cao et al. DOI:10.1016/J.Jep.2020.113422].