Basic Information

Symbol
A4GNT
RNA class
mRNA
Alias
Alpha-1,4-N-Acetylglucosaminyltransferase Alpha4GnT EC 2.4.1.-
Location (GRCh38)
3:138122901-138132390
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Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016161.3
Sequence length
1779.0 nt
GC content
0.4677

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-554.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -589.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016161.3 NCBI
GUCAUUUCUAAGACCUCAAAUACUGGUUAACUGCAUUUGCAGCUAGAAG… 1779 nt 0.4677
Summary

This gene encodes a protein from the glycosyltransferase 32 family. The enzyme catalyzes the transfer of N-acetylglucosamine (GlcNAc) to core 2 branched O-glycans. It forms a unique glycan, GlcNAcalpha1-->4Galbeta-->R and is largely associated with the Golgi apparatus membrane. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in C57BL/6J mice demonstrated that gastrulation-stage alcohol exposure induced craniofacial malformations at similar rates in both sexes, though growth deficits were more prevalent in females [Boschen et al. DOI:10.1002/Bdr2.2292].