Basic Information

Symbol
ARAF
RNA class
mRNA
Alias
A-Raf Proto-Oncogene, Serine/Threonine Kinase A-Raf ARAF1 V-Raf Murine Sarcoma 3611 Viral Oncogene Homolog 1 Serine/Threonine-Protein Kinase A-Raf Proto-Oncogene A-Raf-1 Proto-Oncogene Pks EC 2.7.11.1 PKS2 V-Raf Murine Sarcoma 3611 Viral Oncogene-Like Protein A-Raf Proto-Oncogene Serine/Threonine-Protein Kinase Ras-Binding Protein DA-Raf Proto-Oncogene A-Raf Oncogene ARAF1 EC 2.7.11 RAFA1 PKS
Location (GRCh38)
X:47561182-47571921
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001654.5
Sequence length
2378.0 nt
GC content
0.5900

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-916.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -956.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((.((.((.((.(((((..((((.(((.((((....)).)).))))))).))))))).))))...))))))))...........(((.....((((.(((...((((((((((..(((((((((.((.(((((((((((((((.(.((((((....((.....(((.......)))))..)))))).).))))))))))))))).))..((((((.((...))))))))....(((((.(((((((((.((......(((((.(((.(.(((.((.((((((((((.(((.((..(((.((((((((((.((((((..((((((.........))))))(((((.(((......))).))))).....))))))(((((((.((((......)))).))..........)))))..))))....)))))))))((((((.(((((((.....((((.......))))...((((((((((..((((.(((((.(((((.(((...))).....)))))))).)).)).))..)))......))).)))).........(((.(((.(((....)))))).))).)))).))).))))))..........)).))).)).)))))))).))))).).)))))))).)).)))))))))(((((((((.(((.(((.....)))(((((((((((((((.....((.........))((.(((((((..(((...(((.....((((((..((((........))))...))))))....(((((.((..(((.((((((...(((.(((....))).)))))))))))).)).))))).((((((((((((((((((((.((.(..((...))..).)).))))))))).))...........)))))..)))).....)))..))).))))))).)).((((........))))...............))))))))..))))...)))...((((((((........))))))))))))))).))))).........(((..((((((.((((((...(((....((((((((((((.(((.(.((.((((...(((((...(((((((.....((.....((((((.((((.(((((.((((.(..((.(.(((.(((((..((((((((((((.(((....))).)))).))))..((((.....).)))((((((((((((((....((((((....))))))))((((((...(((....((((.....(((((((((..((((..((((..(((......)))))))))))((((((((...))))..))))(((((.....)))))((((((..((((((((((((((.(((((.((................)).)))))..)))..))))..))).))))..)))))))))))))))))))))).....))))))((.((((((.((((((.((((((....)).....(((((.((((....(((((((...((((...(((((.((((..((((.((((((((.((.((........)).))..))))))))((((...))))..((((((((.((((.((.....(((((...))))))).)))))))).))))......)).))..)).))...)))))...)))))))))))...)))).))))).)))).)))))).).)).))).)).((((...((((......)))).))))((((((((......)))))))).))))))))))))........((....))...((.(((((((((....)).).))))))))..((...)))))).)))))))).)))..)...))))..)))))...)))).))))))...)).))))))).))))).)))).)))))).)))))).((((.....)))).)))))))))))))))))))))..)))..((((..((((..((........))..))))))))..)))))((((((((((.((((...)))).)))).((((((((((.....(..((((((.....))))))..)))))))))))(((((.((..(((((...((..........))...)))))..)))))))...))))))...........(((((((((((......((((.(((..((.((....((((.((((((((...(((...))).)))))))).))))....)).))..))).))))....)))))))))))..)))))).))).....))))))))))....))).))))...)))......))...))))))))......(((((((........))))..)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((,,((((((((.((.((.((.(((((..((((.(((.((((....)).)).))))))).))))))).))))...))))))))...........(((,,...{|||,|{{...((((((((((..(((((((((.{{.(((((((((((((((.(.((((((....((.....(((.......))))}..)))))).).))))))))))))))).}|.,{(((((.||...}))))))}.,,,{||{..(((((((((.((......(((((.(((.(.(((.((.((((((((,,{(((.{,..,{,.(((((,,((,.((((((,.((((((.,......}))))))(((((.(((......))).)))))...,.))))))|||||||.((((......)))}.}|{{{{...})})),},..||||{{{.|,||,,,,,((((((.({{{(((,.....((((((((..((({....,.}}|}.((((({{(,...,({(((((..{,....|({,..{{{{,,,}}}},.))).}},},,.,,,,.},...}.)}......}}})))),,.))}))))).)))))))).}})),))).)))))).....,}},.))}))))),.)))))))).))))).}.)))))))).)).)))))))))(((((((((.(((.(((,...,)))(((((((((((((((....{((,........).)}}(((((((..(({...(((.....((((((..((((........))))...))))))....(((((.((..(((.((((((...{((.(({....})).}))))))))))).)).))))).(((((((({(((((((((({.((.{..((...))..).)).})))))))).))...........)))),.,)))).....)))..))).))))))).,,.((((........))))......,,.....,,))))))))..))))...)))...((((((((........))))))))))))))).)))))..((((...(((..((((((.((((((...(((....((((((((((((.(((((..(.((((...((((({,.{((((((.....((.....((((((.((((.(((((.((((.,..{|.{.(((,({{((,,(({{((((((((.(((....))).)))).))))..((({.....}.)))(((((((((((({{,,{.(((({(.,,,|||}||((((,...}}}|||.,|||{|,,,.,.(((((((((..((((..((((..{({,...,},}}))))))))((((((({...})))..))))(((((.....)))))((((((..(((((((((((({({(((((.({................}}.)))))..,)).)))))..))).))))..)))))))))))))))})),,}....)))))|||(({((((({.((((((.(((({{....}).....(((((.((((....(((((((,..{(((...(((({.....((((((....((....{(.,....,.},..))....)))))),.((((...))))........(((.....)))....((((((...({(((((((((..(({...))))))))))))})))))))).,))))...)))))))))))...)))).))))).)))).)))))).,.)).))).))}|||(...((((......)))}.))))((((((((......)))))))).)))))))))))).....,}}||..}})),..((.(((((({({....}).).)))))))),{((...|||}}},||}}})))..}),,),,,)))}..)))))...)))).))))))}}.),.)))))))}))))).))))}))))}).)))))).((((.....)))).))))))))))))))}))))))..)))..((((..((((..((........))..))))))))}}))|||{(((((((((.((({...}))).)))).((((((((((.....{..((((((.....))))))..}))))))))))((({{{((..(((((...{{..........}}...)))))..)))))))...))))},.,,,,......{((((((((((......((((.(((..((.((....((((.((((((((...(((...})).)))))))).))))....)).))..))).))))....))))))))))}..)))))).))).....))))))))))....))).}}}}...}}}......))...)))))))}.,,,..,,|||||{{,,,,..,,}),,)),..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256196.2 NCBI
AAGAGAGGCCCAAGAUGGAGACGGCGGCGGCUGUAGCGGCGUGACAGGA… 2387 nt 0.5903
NM_001256197.2 NCBI
AAGAGAGGCCCAAGAUGGAGACGGCGGCGGCUGUAGCGGCGUGACAGGA… 1288 nt 0.4457
NM_001654.5 NCBI
AAGAGAGGCCCAAGAUGGAGACGGCGGCGGCUGUAGCGGCGUGACAGGA… 2378 nt 0.5900
Summary

Enables protein serine/threonine kinase activity. Involved in negative regulation of apoptotic process; regulation of TOR signaling; and regulation of protein metabolic process. Predicted to be active in cytosol and mitochondrion. Biomarker of high grade glioma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for ARAF Gene ARAF has recently become increasingly considered for its oncogenic potential. Its potential as a target for informing clinical action was demonstrated by a single case of advanced lung adenocarcinoma harboring an S214C mutation that, when treated with sorafenib, acheived near-complete clinical remission. This finding has brought new focus on ARAF as a marker that should be assayed for in cancer treatment.

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.